RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519835.5

CPEB4-207, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB4, Length 2,257 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-207ENST00000519835 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.72□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 KIAA0232Q92628 1395 aa14.72□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 PTPRCP08575 1304 aa14.72□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 MCTP1Q6DN14 999 aa14.72□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.71□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.71□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 FBLN1P23142 703 aa14.71□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.71□□□□□ -0.05
CPEB4-207ENST00000519835 MSH6P52701 1360 aa14.71□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 COG3Q96JB2 828 aa14.71□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 RTL1A6NKG5 1358 aa14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 CEP85Q6P2H3 762 aa14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 NME9Q86XW9 330 aa14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 CPS1P31327 1500 aa14.7□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.69□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 SDSP20132 328 aa14.69□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.69□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 FAM83GA6ND36 823 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 HMMRO75330 724 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 TERF1P54274 439 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 AGLP35573 1532 aa14.68□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 ERC2O15083 957 aa14.67□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 OFD1O75665 1012 aa14.67□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 MCM2P49736 904 aa14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.66□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.65□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 TECPR2O15040 1411 aa14.65□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 CHL1O00533 1208 aa14.65□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.65□□□□□ -0.06
CPEB4-207ENST00000519835 MBD3O95983 291 aa14.64□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 DCTN1Q14203 1278 aa14.64□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PKP1Q13835 747 aa14.64□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CACNA1FO60840 1977 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 MEIS3Q99687 375 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 RBSNQ9H1K0 784 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 SSH2Q76I76 1423 aa14.63□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 MCM5P33992 734 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 GPT2Q8TD30 523 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ARHGEF10O15013 1369 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PEAK1Q9H792 1746 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 MCCP23508 829 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 SIRT1Q96EB6 747 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.62□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 OVOS2Q6IE36 1432 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CRB1P82279 1406 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PDE1AP54750 535 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.61□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 OSCARQ8IYS5 282 aa14.6□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 APBB1O00213 710 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ANAPC15P60006 121 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 LRRC37A3O60309 1634 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 KRT24Q2M2I5 525 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.59□□□□□ -0.07
CPEB4-207ENST00000519835 PLEKHG5O94827 1062 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 CUL4AQ13619 759 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 TMX3Q96JJ7 454 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 METP08581 1390 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 BRD1O95696 1058 aa14.58□□□□□ -0.08
CPEB4-207ENST00000519835 MCM10Q7L590 875 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms