RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517006.1

RNU6-410P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 410, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-410P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-410P-201ENST00000517006 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-410P-201ENST00000517006 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 EML3Q32P44 896 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 RELBQ01201 579 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP4Q13107 963 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SERPINA10Q9UK55 444 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SPINT1O43278 529 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTGIRP43119 386 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLDN10P78369 228 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM52Q96A61 297 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIRT1Q96EB6 747 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIAA1024Q9UPX6 916 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 NOD1Q9Y239 953 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCNN1DP51172 638 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 GTF2IP78347 998 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZFP42Q96MM3 310 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-410P-201ENST00000517006 IL2RAP01589 272 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 BMP2P12643 396 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 A0A1W2PRU2 124 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 POTECB2RU33 542 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 DKK1O94907 266 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 UPP2O95045 317 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 GNRH1P01148 92 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 RFX1P22670 979 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CLN3Q13286 438 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SCARF1Q14162 830 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 OGFOD1Q8N543 542 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM47Q96LD4 638 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 WASLO00401 505 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TRIM50Q86XT4 487 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SIX5Q8N196 739 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 FAM196BA6NMK8 535 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L15C9J2P7 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L10C9JJH3 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L12C9JPN9 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L11C9JVI0 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L21D6R901 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L18D6R9N7 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L22D6RA61 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L19D6RCP7 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L20D6RJB6 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 MEN1O00255 615 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ATP1A2P50993 1020 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 GDF10P55107 478 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 USP17L24Q0WX57 530 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 PTK7Q13308 1070 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 RNF217Q8TC41 542 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SENP2Q9HC62 589 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 SOBPA7XYQ1 873 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 INHAP05111 366 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 RASA1P20936 1047 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 PSME1Q06323 249 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 CDCA8Q53HL2 280 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 KIFC2Q96AC6 838 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-410P-201ENST00000517006 XAGE2Q96GT9 111 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms