RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 CFAP53Q96M91 514 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 SPG7Q9UQ90 795 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 PPP2R1AP30153 589 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-215ENST00000514625 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 RALBP1Q15311 655 aa24.07■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 SBF2Q86WG5 1849 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 KCNQ2O43526 872 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.06■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.05■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 CYP27B1O15528 508 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 NUDCQ9Y266 331 aa24.04■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 KDRP35968 1356 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 PLSCR1O15162 318 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 HMOX1P09601 288 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 NHSQ6T4R5 1651 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-215ENST00000514625 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 PHKG2P15735 406 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.97■■□□□ 1.43
FAAP20-215ENST00000514625 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.95■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 NBPF14Q5TI25 921 aa23.94■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 DCAF5Q96JK2 942 aa23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.93■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 TXNRD1Q16881 649 aa23.92■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 BTAF1O14981 1849 aa23.91■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.9■■□□□ 1.42
FAAP20-215ENST00000514625 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.89■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 PROM2Q8N271 834 aa23.89■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 RREB1Q92766 1687 aa23.89■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.88■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 FCHSD2O94868 740 aa23.88■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 PRKAR2BP31323 418 aa23.88■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.87■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.86■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.86■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 PIGBQ92521 554 aa23.86■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 NEFMP07197 916 aa23.85■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 CABP4P57796 275 aa23.85■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
FAAP20-215ENST00000514625 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 STK32BQ9NY57 414 aa23.82■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 PALLDQ8WX93 1383 aa23.81■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.81■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 ITGB4P16144 1822 aa23.81■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 ANP32CO43423 234 aa23.8■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.79■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.78■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 LGR6Q9HBX8 967 aa23.78■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 MAP3K5Q99683 1374 aa23.78■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.77■■□□□ 1.4
FAAP20-215ENST00000514625 KCNQ4P56696 695 aa23.76■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 SLC15A2Q16348 729 aa23.76■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 ATG3Q9NT62 314 aa23.76■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 LY75O60449 1722 aa23.75■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.73■■□□□ 1.39
FAAP20-215ENST00000514625 SIK1P57059 783 aa23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms