RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512731.5

MMP23B-210, Transcript of matrix metallopeptidase 23B, humanhuman

TSL 2

Gene MMP23B, Length 1,531 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP23B-210ENST00000512731 PKD1L3Q7Z443 1732 aa34.32■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 FAM196AQ6ZSG2 479 aa34.31■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 BCL9O00512 1426 aa34.31■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP34.29■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 AEBP1Q8IUX7 1158 aa34.27■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 SULT6B1Q6IMI4 303 aa34.26■■■■□ 3.08
MMP23B-210ENST00000512731 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa34.22■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa34.22■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 CCDC125Q86Z20 511 aa34.22■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP34.22■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 SBF2Q86WG5 1849 aa34.21■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
MMP23B-210ENST00000512731 NUDCQ9Y266 331 aa34.2■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 HMOX1P09601 288 aa34.19■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 SPG7Q9UQ90 795 aa34.19■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 TRIM37O94972 964 aa34.16■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 CYP27B1O15528 508 aa34.15■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 NHSQ6T4R5 1651 aa34.15■■■■□ 3.06
MMP23B-210ENST00000512731 AMOTQ4VCS5 1084 aa34.13■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 DOT1LQ8TEK3 1739 aa34.12■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 ANP32CO43423 234 aa34.09■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP34.09■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 PHKG2P15735 406 aa34.08■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 RSPH6AQ9H0K4 717 aa34.08■■■■□ 3.05
MMP23B-210ENST00000512731 IFNL2Q8IZJ0 200 aa34.07■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.07■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa34.05■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 KCNQ2O43526 872 aa34.04■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 PTF1AQ7RTS3 328 aa34.04■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 BAG6P46379 1132 aa34.04■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 FCHSD2O94868 740 aa34.03■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 PRKAR2BP31323 418 aa34.03■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.03■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 APBA3O96018 575 aa34.01■■■■□ 3.04
MMP23B-210ENST00000512731 BTAF1O14981 1849 aa33.99■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa33.99■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.99■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.97■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.95■■■■□ 3.03
MMP23B-210ENST00000512731 DCAF5Q96JK2 942 aa33.94■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.94■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 ITGB4P16144 1822 aa33.94■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 GAS2L2Q8NHY3 880 aa33.94■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 PLSCR1O15162 318 aa33.93■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 CAMKK2Q96RR4 588 aa33.93■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 PLEKHF1Q96S99 279 aa33.9■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 RREB1Q92766 1687 aa33.9■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.9■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.9■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 CCDC184Q52MB2 194 aa33.89■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
MMP23B-210ENST00000512731 MAP3K5Q99683 1374 aa33.88■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.88■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.87■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 NEFMP07197 916 aa33.85■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 MRC1P22897 1456 aa33.84■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.84■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 PIGBQ92521 554 aa33.84■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.83■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 MRS2Q9HD23 443 aa33.83■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 ADAMTS8Q9UP79 889 aa33.83■■■■□ 3.01
MMP23B-210ENST00000512731 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa33.82■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.82■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 RNMTO43148 476 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 LY75O60449 1722 aa33.81■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 LGR6Q9HBX8 967 aa33.8■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 CABP4P57796 275 aa33.79■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 PROM2Q8N271 834 aa33.79■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 TXNRD1Q16881 649 aa33.78■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 PALLDQ8WX93 1383 aa33.76■■■■□ 3
MMP23B-210ENST00000512731 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa33.75■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 SLC52A2Q9HAB3 445 aa33.75■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 DLG5Q8TDM6 1919 aa33.75■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 NFE2L2Q16236 605 aa33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 IL17REQ8NFR9 667 aa33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 CCDC146Q8IYE0 955 aa33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa33.74■■■□□ 2.99
MMP23B-210ENST00000512731 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms