RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNQ2O43526 872 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.65■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP5O75197 1615 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 PAPPAQ13219 1627 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 LY75O60449 1722 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-218ENST00000511185 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 MORC1Q86VD1 984 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 CASZ1Q86V15 1759 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 EYA1Q99502 592 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-218ENST00000511185 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PLSCR1O15162 318 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.54■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PROM2Q8N271 834 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP2-218ENST00000511185 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.51■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 CYP27B1O15528 508 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 C5P01031 1676 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNRD1Q16881 649 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP2-218ENST00000511185 MTHFSP49914 203 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 IL13P35225 146 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 KDRP35968 1356 aa25.43■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.41■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 NBPF14Q5TI25 921 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 SPG7Q9UQ90 795 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNQ4P56696 695 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PHKG2P15735 406 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF827Q17R98 1081 aa25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 C4BP0C0L5 1744 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP2-218ENST00000511185 PALLDQ8WX93 1383 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HMOX1P09601 288 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 STK32BQ9NY57 414 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC15A2Q16348 729 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGBQ92521 554 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP2R1AP30153 589 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TJP1Q07157 1748 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MRC1P22897 1456 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-218ENST00000511185 AKT1S1Q96B36 256 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ZBTB7AO95365 584 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 DCAF5Q96JK2 942 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 C4AP0C0L4 1744 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ATG3Q9NT62 314 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 SPON1Q9HCB6 807 aa25.17■■□□□ 1.62
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.16■■□□□ 1.62
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