RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510623.1

RHOBTB3-211, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RHOBTB3, Length 333 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3-211ENST00000510623 CREBZFQ9NS37 354 aa7.55□□□□□ -1.2
RHOBTB3-211ENST00000510623 CNTNAP1P78357 1384 aa7.55□□□□□ -1.2
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RHOBTB3-211ENST00000510623 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.54□□□□□ -1.2
RHOBTB3-211ENST00000510623 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.53□□□□□ -1.2
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RHOBTB3-211ENST00000510623 LMO7Q8WWI1 1683 aa7.53□□□□□ -1.2
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RHOBTB3-211ENST00000510623 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.51□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.5□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 SOX10P56693 466 aa7.5□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 BCS1LQ9Y276 419 aa7.5□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 DAPK1P53355 1430 aa7.5□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.47□□□□□ -1.21
RHOBTB3-211ENST00000510623 COL18A1P39060 1754 aa7.47□□□□□ -1.21
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RHOBTB3-211ENST00000510623 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.43□□□□□ -1.22
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RHOBTB3-211ENST00000510623 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa7.43□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 LY75O60449 1722 aa7.43□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.43□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.42□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 TSKSQ9UJT2 592 aa7.42□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 USP54Q70EL1 1684 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.41□□□□□ -1.22
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RHOBTB3-211ENST00000510623 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 CACNA1AO00555 2505 aa7.41□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 SZT2Q5T011 3432 aa7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 POTEB2H3BUK9 544 aa7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 TGFB2P61812 414 aa7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 ABCC6O95255 1503 aa7.4□□□□□ -1.22
RHOBTB3-211ENST00000510623 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.4□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 TIAM2Q8IVF5 1701 aa7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 WDR17Q8IZU2 1322 aa7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 A0A0G2JLW4 131 aa7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.39□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 LTBP1Q14766 1721 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 C5P01031 1676 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 THSD7BQ9C0I4 1608 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 CEP290O15078 2479 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 NUP155O75694 1391 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 PASKQ96RG2 1323 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 RASSF10A6NK89 507 aa7.38□□□□□ -1.23
RHOBTB3-211ENST00000510623 POTEGQ6S5H5 508 aa7.38□□□□□ -1.23
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