RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.33■■□□□ 1.81
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USP46-AS1-201ENST00000503051 NBPF4Q96M43 638 aa26.32■■□□□ 1.8
USP46-AS1-201ENST00000503051 NSD2O96028 1365 aa26.32■■□□□ 1.8
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USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.1■■□□□ 1.77
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USP46-AS1-201ENST00000503051 PTGER2P43116 358 aa25.91■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.91■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDRP35968 1356 aa25.91■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.9■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.9■■□□□ 1.74
USP46-AS1-201ENST00000503051 MSH5O43196 834 aa25.88■■□□□ 1.73
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USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.87■■□□□ 1.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLD1P28340 1107 aa25.85■■□□□ 1.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP2R1AP30153 589 aa25.85■■□□□ 1.73
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USP46-AS1-201ENST00000503051 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.84■■□□□ 1.73
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.84■■□□□ 1.73
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USP46-AS1-201ENST00000503051 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.84■■□□□ 1.73
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