RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa34.03■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.03■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP34.02■■■■□ 3.04
CXCL3-202ENST00000502974 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 ACSBG1Q96GR2 724 aa34.01■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 PLSCR1O15162 318 aa34■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 TATP17735 454 aaPredicted RBP33.98■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.98■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa33.98■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 KCNQ2O43526 872 aa33.97■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 NBPF14Q5TI25 921 aa33.95■■■■□ 3.03
CXCL3-202ENST00000502974 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa33.93■■■■□ 3.02
CXCL3-202ENST00000502974 EYA1Q99502 592 aa33.92■■■■□ 3.02
CXCL3-202ENST00000502974 BTAF1O14981 1849 aa33.92■■■■□ 3.02
CXCL3-202ENST00000502974 NCAPD2Q15021 1401 aa33.91■■■■□ 3.02
CXCL3-202ENST00000502974 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33.89■■■■□ 3.02
CXCL3-202ENST00000502974 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa33.87■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa33.87■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 MTHFSP49914 203 aa33.86■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.84■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 TXNRD1Q16881 649 aa33.84■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 PROM2Q8N271 834 aa33.83■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.82■■■■□ 3.01
CXCL3-202ENST00000502974 LRP5O75197 1615 aa33.82■■■■□ 3
CXCL3-202ENST00000502974 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
CXCL3-202ENST00000502974 SPG7Q9UQ90 795 aa33.79■■■■□ 3
CXCL3-202ENST00000502974 IL13P35225 146 aa33.77■■■■□ 3
CXCL3-202ENST00000502974 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 CYP27B1O15528 508 aa33.75■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.74■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 STK32BQ9NY57 414 aa33.73■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 AEBP1Q8IUX7 1158 aa33.71■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.71■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
CXCL3-202ENST00000502974 SULT6B1Q6IMI4 303 aa33.69■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.67■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 PPP2R1AP30153 589 aa33.67■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.67■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 LY75O60449 1722 aa33.66■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 PAPPAQ13219 1627 aa33.66■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 SLC15A2Q16348 729 aa33.66■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 ITGB4P16144 1822 aa33.65■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 IFNL2Q8IZJ0 200 aa33.65■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 KDRP35968 1356 aa33.64■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa33.64■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.64■■■□□ 2.98
CXCL3-202ENST00000502974 PHKG2P15735 406 aa33.63■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 CFAP53Q96M91 514 aa33.63■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 CASZ1Q86V15 1759 aa33.62■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 HMOX1P09601 288 aa33.61■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
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CXCL3-202ENST00000502974 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 SPON1Q9HCB6 807 aa33.58■■■□□ 2.97
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP33.57■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 KCNQ4P56696 695 aa33.56■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF827Q17R98 1081 aa33.55■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.55■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 PALLDQ8WX93 1383 aa33.55■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 PIGBQ92521 554 aa33.54■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 C1orf141Q5JVX7 400 aa33.52■■■□□ 2.96
CXCL3-202ENST00000502974 AKT1S1Q96B36 256 aa33.51■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB7AO95365 584 aa33.5■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 DCAF5Q96JK2 942 aa33.49■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 NUDCQ9Y266 331 aa33.49■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.48■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 RALBP1Q15311 655 aa33.48■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP33.48■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 C5P01031 1676 aa33.48■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa33.47■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.46■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.45■■■□□ 2.95
CXCL3-202ENST00000502974 TAF1LQ8IZX4 1826 aa33.44■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 MTFR1LQ9H019 292 aa33.44■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP33.43■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.42■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 AKAP4Q5JQC9 854 aa33.41■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 ASAP1Q9ULH1 1129 aa33.41■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa33.4■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 CABP4P57796 275 aa33.4■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 SCN11AQ9UI33 1791 aa33.39■■■□□ 2.94
CXCL3-202ENST00000502974 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa33.38■■■□□ 2.93
CXCL3-202ENST00000502974 SIK1P57059 783 aa33.38■■■□□ 2.93
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