RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497628.1

TPRG1-215, Transcript of tumor protein p63 regulated 1, human

TSL 3

Gene TPRG1, Length 350 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRG1-215	ENST00000497628	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628		H7C1W4	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	GOPC	Q9HD26	462 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	LILRA1	O75019	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	IRS1	P35568	1242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	RASSF7	Q02833	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	KCNMA1	Q12791	1236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628		A0A1W2PRU2	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	ESPN	B1AK53	854 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	ADAMTS2	O95450	1211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	FBXO45	P0C2W1	286 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	KRT76	Q01546	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	POU4F2	Q12837	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	PODN	Q7Z5L7	613 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPRG1-215	ENST00000497628	NR1H3	Q13133	447 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GPR25	O00155	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GPC1	P35052	558 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	WHAMM	Q8TF30	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SLURP2	P0DP57	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	MX2	P20592	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	KANK3	Q6NY19	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	PHKA2	P46019	1235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ERVK-9	P63128	1117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	F11	P03951	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CLN3	Q13286	438 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	DBN1	Q16643	649 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	IGF1R	P08069	1367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GNRH1	P01148	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	BCR	P11274	1271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SCTR	P47872	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	USP4	Q13107	963 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	SIRT1	Q96EB6	747 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ARHGEF15	O94989	841 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	IGHA1	P01876	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	AMPD1	P23109	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	FOXK2	Q01167	660 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CENPC	Q03188	943 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TPRG1-215	ENST00000497628	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		4.84	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms