RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496725.1

KIDINS220-211, Transcript of kinase D interacting substrate 220, humanhuman

TSL 4

Gene KIDINS220, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIDINS220-211ENST00000496725 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.62■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.6■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 EYA1Q99502 592 aa22.59■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.58■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
KIDINS220-211ENST00000496725 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 KCNQ2O43526 872 aa22.56■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.55■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 BTAF1O14981 1849 aa22.54■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.54■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.54■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.54■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 PROM2Q8N271 834 aa22.53■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 NBPF14Q5TI25 921 aa22.52■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.52■■□□□ 1.2
KIDINS220-211ENST00000496725 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.51■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 TXNRD1Q16881 649 aa22.49■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 SPG7Q9UQ90 795 aa22.49■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 CYP27B1O15528 508 aa22.48■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 LRP5O75197 1615 aa22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 IL13P35225 146 aa22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 MTHFSP49914 203 aa22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 KDRP35968 1356 aa22.46■■□□□ 1.19
KIDINS220-211ENST00000496725 LY75O60449 1722 aa22.44■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 PAPPAQ13219 1627 aa22.42■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.42■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.42■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 ITGB4P16144 1822 aa22.41■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.41■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 PHKG2P15735 406 aa22.4■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.4■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
KIDINS220-211ENST00000496725 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 SLC15A2Q16348 729 aa22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 CASZ1Q86V15 1759 aa22.37■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 STK32BQ9NY57 414 aa22.36■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.34■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 DCAF5Q96JK2 942 aa22.33■■□□□ 1.17
KIDINS220-211ENST00000496725 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.32■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.32■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 PIGBQ92521 554 aa22.32■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 AKT1S1Q96B36 256 aa22.31■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 PPP2R1AP30153 589 aa22.3■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 PALLDQ8WX93 1383 aa22.29■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 CFAP53Q96M91 514 aa22.29■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.29■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 SPON1Q9HCB6 807 aa22.28■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.28■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF827Q17R98 1081 aa22.27■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.27■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.27■■□□□ 1.16
KIDINS220-211ENST00000496725 HMOX1P09601 288 aa22.26■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.26■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 C5P01031 1676 aa22.26■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.26■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.24■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.24■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.23■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 KCNQ4P56696 695 aa22.22■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 ATG3Q9NT62 314 aa22.22■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.22■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.21■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 MTFR1LQ9H019 292 aa22.21■■□□□ 1.15
KIDINS220-211ENST00000496725 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.2■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 SIK1P57059 783 aa22.2■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 CABP4P57796 275 aa22.2■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 RALBP1Q15311 655 aa22.19■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.19■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 MRC1P22897 1456 aa22.19■■□□□ 1.14
KIDINS220-211ENST00000496725 C4BP0C0L5 1744 aa22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms