RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.37■■□□□ 1.33
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USP20-208ENST00000494971 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.36■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 KCNQ2O43526 872 aa23.34■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.33■■□□□ 1.33
USP20-208ENST00000494971 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 EYA1Q99502 592 aa23.32■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.3■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.3■■□□□ 1.32
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USP20-208ENST00000494971 BTAF1O14981 1849 aa23.29■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.29■■□□□ 1.32
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USP20-208ENST00000494971 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.27■■□□□ 1.32
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USP20-208ENST00000494971 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.27■■□□□ 1.32
USP20-208ENST00000494971 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.27■■□□□ 1.31
USP20-208ENST00000494971 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.26■■□□□ 1.31
USP20-208ENST00000494971 TXNRD1Q16881 649 aa23.25■■□□□ 1.31
USP20-208ENST00000494971 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
USP20-208ENST00000494971 CYP27B1O15528 508 aa23.23■■□□□ 1.31
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USP20-208ENST00000494971 MTHFSP49914 203 aa23.19■■□□□ 1.3
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USP20-208ENST00000494971 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.14■■□□□ 1.29
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USP20-208ENST00000494971 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.14■■□□□ 1.29
USP20-208ENST00000494971 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.14■■□□□ 1.29
USP20-208ENST00000494971 ITGB4P16144 1822 aa23.13■■□□□ 1.29
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USP20-208ENST00000494971 CASZ1Q86V15 1759 aa23.12■■□□□ 1.29
USP20-208ENST00000494971 SLC15A2Q16348 729 aa23.12■■□□□ 1.29
USP20-208ENST00000494971 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.11■■□□□ 1.29
USP20-208ENST00000494971 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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USP20-208ENST00000494971 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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USP20-208ENST00000494971 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
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USP20-208ENST00000494971 KCNQ4P56696 695 aa23.02■■□□□ 1.28
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USP20-208ENST00000494971 ZBTB7AO95365 584 aa22.97■■□□□ 1.27
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USP20-208ENST00000494971 ATG3Q9NT62 314 aa22.96■■□□□ 1.27
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USP20-208ENST00000494971 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.94■■□□□ 1.26
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USP20-208ENST00000494971 CABP4P57796 275 aa22.93■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 C4BP0C0L5 1744 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.92■■□□□ 1.26
USP20-208ENST00000494971 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.91■■□□□ 1.26
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