RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CHD1L-209ENST00000492728 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
CHD1L-209ENST00000492728 SLC15A2Q16348 729 aa25.64■■□□□ 1.7
CHD1L-209ENST00000492728 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.64■■□□□ 1.7
CHD1L-209ENST00000492728 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 STK32BQ9NY57 414 aa25.63■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.63■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB7AO95365 584 aa25.62■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.62■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF827Q17R98 1081 aa25.61■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.59■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 NCAPD2Q15021 1401 aa25.59■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 PTGER2P43116 358 aa25.58■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.58■■□□□ 1.69
CHD1L-209ENST00000492728 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.56■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 LY75O60449 1722 aa25.56■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 KCNQ4P56696 695 aa25.55■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.54■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.54■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 AKT1S1Q96B36 256 aa25.53■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 POLKQ9UBT6 870 aa25.53■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.52■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.52■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.52■■□□□ 1.68
CHD1L-209ENST00000492728 CYP27B1O15528 508 aa25.5■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.5■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.5■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.5■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 PANK3Q9H999 370 aa25.5■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 MTFR1LQ9H019 292 aa25.49■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.49■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 EYA1Q99502 592 aa25.48■■□□□ 1.67
CHD1L-209ENST00000492728 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.45■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 UTRNP46939 3433 aa25.43■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 ITGB4P16144 1822 aa25.41■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.4■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 PALLDQ8WX93 1383 aa25.4■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 C5P01031 1676 aa25.39■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.39■■□□□ 1.66
CHD1L-209ENST00000492728 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.38■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 ARXQ96QS3 562 aa25.37■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 SYT17Q9BSW7 474 aa25.37■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.37■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.37■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.35■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 PIGBQ92521 554 aa25.35■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 SPG7Q9UQ90 795 aa25.35■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 PHKG2P15735 406 aa25.33■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.33■■□□□ 1.65
CHD1L-209ENST00000492728 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.654e-12■□□□□ 10.5
CHD1L-209ENST00000492728 MAP3K5Q99683 1374 aa25.32■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 MORC1Q86VD1 984 aa25.32■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.31■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 C4BP0C0L5 1744 aa25.3■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 YY1P25490 414 aa25.29■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.29■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.28■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.28■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.28■■□□□ 1.64
CHD1L-209ENST00000492728 SMIM5Q71RC9 77 aa25.26■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.26■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 MSL1Q68DK7 614 aa25.25■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.25■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.23■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.23■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 MSH5O43196 834 aa25.23■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 POLD1P28340 1107 aa25.23■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.23■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 IL13P35225 146 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 SIK1P57059 783 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 ITPK1Q13572 414 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 KLHL34Q8N239 644 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 ATG3Q9NT62 314 aa25.22■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 KDRP35968 1356 aa25.21■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.21■■□□□ 1.63
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CHD1L-209ENST00000492728 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.18■■□□□ 1.62
CHD1L-209ENST00000492728 AK7Q96M32 723 aa25.18■■□□□ 1.62
CHD1L-209ENST00000492728 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.18■■□□□ 1.62
CHD1L-209ENST00000492728 PHF14O94880 888 aa25.17■■□□□ 1.62
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