RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 MCM10Q7L590 875 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.54■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 GCP02774 474 aa25.53■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 MSH6P52701 1360 aa25.52■■□□□ 1.68
NELFE-211ENST00000492185 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
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NELFE-211ENST00000492185 PDE4AP27815 886 aa25.46■■□□□ 1.67
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NELFE-211ENST00000492185 NBPF4Q96M43 638 aa25.46■■□□□ 1.67
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NELFE-211ENST00000492185 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.46■■□□□ 1.67
NELFE-211ENST00000492185 ABCC4O15439 1325 aa25.45■■□□□ 1.66
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NELFE-211ENST00000492185 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.44■■□□□ 1.66
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NELFE-211ENST00000492185 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.44■■□□□ 1.66
NELFE-211ENST00000492185 COL18A1P39060 1754 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-211ENST00000492185 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-211ENST00000492185 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.43■■□□□ 1.66
NELFE-211ENST00000492185 ABCC6O95255 1503 aa25.43■■□□□ 1.66
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NELFE-211ENST00000492185 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
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NELFE-211ENST00000492185 KRT24Q2M2I5 525 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFE-211ENST00000492185 IL17REQ8NFR9 667 aa25.4■■□□□ 1.66
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NELFE-211ENST00000492185 RGS12O14924 1447 aa25.39■■□□□ 1.65
NELFE-211ENST00000492185 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.39■■□□□ 1.65
NELFE-211ENST00000492185 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.38■■□□□ 1.65
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NELFE-211ENST00000492185 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
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NELFE-211ENST00000492185 BRINP3Q76B58 766 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 RGS3P49796 1198 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 FAM161AQ3B820 660 aa25.31■■□□□ 1.64
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NELFE-211ENST00000492185 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 C8orf34Q49A92 452 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 CPDO75976 1380 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-211ENST00000492185 MSH5O43196 834 aa25.3■■□□□ 1.64
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NELFE-211ENST00000492185 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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NELFE-211ENST00000492185 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-211ENST00000492185 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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NELFE-211ENST00000492185 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-211ENST00000492185 PLEKHG5O94827 1062 aa25.23■■□□□ 1.63
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NELFE-211ENST00000492185 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 G2E3Q7L622 706 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-211ENST00000492185 STK31Q9BXU1 1019 aa25.18■■□□□ 1.62
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