RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491491.1

MYCBP2-209, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene MYCBP2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-209	ENST00000491491	RUNDC1	Q96C34	613 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MYCBP2-209	ENST00000491491	FCHSD2	O94868	740 aa		31.48	■■■□□ 2.63
MYCBP2-209	ENST00000491491	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		31.47	■■■□□ 2.63
MYCBP2-209	ENST00000491491	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	HMOX1	P09601	288 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	LRRC37A3	O60309	1634 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		31.44	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	EXOC5	O00471	708 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	TRIM37	O94972	964 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	IL2RB	P14784	551 aa		31.43	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	EYA1	Q99502	592 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.42	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	APAF1	O14727	1248 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	NEFM	P07197	916 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		31.41	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		31.4	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRKAR2B	P31323	418 aa		31.39	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
MYCBP2-209	ENST00000491491	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.38	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	NGEF	Q8N5V2	710 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNS2	Q63HR2	1409 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	BAG6	P46379	1132 aa		31.33	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
MYCBP2-209	ENST00000491491	APBA3	O96018	575 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	KDR	P35968	1356 aa		31.3	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	NEUROD2	Q15784	382 aa		31.29	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		31.28	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	MEGF6	O75095	1541 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	BCL9	O00512	1426 aa		31.26	■■■□□ 2.6
MYCBP2-209	ENST00000491491	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.25	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	NFE2L2	Q16236	605 aa		31.24	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		31.23	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	SBF2	Q86WG5	1849 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	RIPK4	P57078	832 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	KCNQ2	O43526	872 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	CCDC27	Q2M243	656 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	NCAPD2	Q15021	1401 aa		31.2	■■■□□ 2.59
MYCBP2-209	ENST00000491491	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	GOLGA2	Q08379	1002 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		31.14	■■■□□ 2.58
MYCBP2-209	ENST00000491491	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLSCR1	O15162	318 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	CYP27B1	O15528	508 aa		31.08	■■■□□ 2.57
MYCBP2-209	ENST00000491491	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	PROM2	Q8N271	834 aa		31.07	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491		E9PSI1	815 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	SLFN5	Q08AF3	891 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	31.04	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPG7	Q9UQ90	795 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		31.02	■■■□□ 2.56
MYCBP2-209	ENST00000491491	IL16	Q14005	1332 aa		31	■■■□□ 2.55
MYCBP2-209	ENST00000491491	RREB1	Q92766	1687 aa		31	■■■□□ 2.55
MYCBP2-209	ENST00000491491	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
MYCBP2-209	ENST00000491491	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		30.99	■■■□□ 2.55
MYCBP2-209	ENST00000491491	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
MYCBP2-209	ENST00000491491	TXNRD1	Q16881	649 aa		30.99	■■■□□ 2.55

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