RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491269.1

C3orf18-211, Transcript of chromosome 3 open reading frame 18, humanhuman

TSL 4

Gene C3orf18, Length 531 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18-211ENST00000491269 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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C3orf18-211ENST00000491269 PLSCR1O15162 318 aa28.86■■■□□ 2.21
C3orf18-211ENST00000491269 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
C3orf18-211ENST00000491269 EYA1Q99502 592 aa28.85■■■□□ 2.21
C3orf18-211ENST00000491269 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.84■■■□□ 2.21
C3orf18-211ENST00000491269 NHSQ6T4R5 1651 aa28.84■■■□□ 2.21
C3orf18-211ENST00000491269 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.84■■■□□ 2.21
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C3orf18-211ENST00000491269 PROM2Q8N271 834 aa28.83■■■□□ 2.21
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C3orf18-211ENST00000491269 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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C3orf18-211ENST00000491269 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.78■■■□□ 2.2
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C3orf18-211ENST00000491269 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
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C3orf18-211ENST00000491269 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.74■■■□□ 2.19
C3orf18-211ENST00000491269 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.74■■■□□ 2.19
C3orf18-211ENST00000491269 CYP27B1O15528 508 aa28.74■■■□□ 2.19
C3orf18-211ENST00000491269 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.7■■■□□ 2.19
C3orf18-211ENST00000491269 MTHFSP49914 203 aa28.69■■■□□ 2.18
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C3orf18-211ENST00000491269 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.69■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.67■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 KCNQ4P56696 695 aa28.66■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 IL13P35225 146 aa28.65■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.65■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 STK32BQ9NY57 414 aa28.64■■■□□ 2.18
C3orf18-211ENST00000491269 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.63■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.62■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 LRP5O75197 1615 aa28.61■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 SLC15A2Q16348 729 aa28.61■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.61■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.6■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 PHKG2P15735 406 aa28.6■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.59■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 ZNF827Q17R98 1081 aa28.58■■■□□ 2.17
C3orf18-211ENST00000491269 PAPPAQ13219 1627 aa28.56■■■□□ 2.16
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C3orf18-211ENST00000491269 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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C3orf18-211ENST00000491269 ITGB4P16144 1822 aa28.54■■■□□ 2.16
C3orf18-211ENST00000491269 LY75O60449 1722 aa28.53■■■□□ 2.16
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C3orf18-211ENST00000491269 KDRP35968 1356 aa28.51■■■□□ 2.16
C3orf18-211ENST00000491269 PALLDQ8WX93 1383 aa28.5■■■□□ 2.15
C3orf18-211ENST00000491269 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.5■■■□□ 2.15
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C3orf18-211ENST00000491269 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.5■■■□□ 2.15
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C3orf18-211ENST00000491269 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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C3orf18-211ENST00000491269 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.45■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.45■■■□□ 2.14
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C3orf18-211ENST00000491269 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.44■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 ATG3Q9NT62 314 aa28.41■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.41■■■□□ 2.14
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C3orf18-211ENST00000491269 CFAP53Q96M91 514 aa28.4■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 CABP4P57796 275 aa28.39■■■□□ 2.14
C3orf18-211ENST00000491269 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.39■■■□□ 2.13
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C3orf18-211ENST00000491269 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 MTFR1LQ9H019 292 aa28.38■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.37■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 PTGER2P43116 358 aa28.37■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 SIK1P57059 783 aa28.37■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 C5P01031 1676 aa28.37■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.36■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 MSH5O43196 834 aa28.35■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 LGR6Q9HBX8 967 aa28.35■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.34■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.34■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 ATP6V1AP38606 617 aa28.33■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 ITPK1Q13572 414 aa28.33■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 SMIM5Q71RC9 77 aa28.33■■■□□ 2.13
C3orf18-211ENST00000491269 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
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