RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 USHBP1Q8N6Y0 703 aa33.17■■■□□ 2.9
EHD1-211ENST00000489379 NHSQ6T4R5 1651 aa33.16■■■□□ 2.9
EHD1-211ENST00000489379 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
EHD1-211ENST00000489379 RREB1Q92766 1687 aa33.15■■■□□ 2.9
EHD1-211ENST00000489379 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.14■■■□□ 2.89
EHD1-211ENST00000489379 EYA1Q99502 592 aa33.13■■■□□ 2.89
EHD1-211ENST00000489379 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa33.09■■■□□ 2.89
EHD1-211ENST00000489379 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa33.07■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa33.07■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 NUP188Q5SRE5 1749 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 PKD1L3Q7Z443 1732 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.06■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 KCNQ2O43526 872 aa33.05■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 NBPF14Q5TI25 921 aa33.05■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 IGSF1Q8N6C5 1336 aa33.04■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 BTAF1O14981 1849 aa33.03■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 SPG7Q9UQ90 795 aa33.03■■■□□ 2.88
EHD1-211ENST00000489379 DOT1LQ8TEK3 1739 aa33■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 MTHFSP49914 203 aa33■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 CYP27B1O15528 508 aa32.95■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 IL13P35225 146 aa32.95■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 TXNRD1Q16881 649 aa32.95■■■□□ 2.87
EHD1-211ENST00000489379 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 PROM2Q8N271 834 aa32.94■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP32.92■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 IFNL2Q8IZJ0 200 aa32.9■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 KDRP35968 1356 aa32.89■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 AMOTQ4VCS5 1084 aa32.89■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
EHD1-211ENST00000489379 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 ITGB4P16144 1822 aa32.86■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP32.86■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 SLC27A3Q5K4L6 730 aa32.86■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 SULT6B1Q6IMI4 303 aa32.86■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 PHKG2P15735 406 aa32.85■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 LY75O60449 1722 aa32.83■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
EHD1-211ENST00000489379 LRP5O75197 1615 aa32.82■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 CFAP53Q96M91 514 aa32.82■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 STK32BQ9NY57 414 aa32.82■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa32.82■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 AEBP1Q8IUX7 1158 aa32.81■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP32.79■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa32.78■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 SLC15A2Q16348 729 aa32.77■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 PAPPAQ13219 1627 aa32.77■■■□□ 2.84
EHD1-211ENST00000489379 PPP2R1AP30153 589 aa32.76■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 DCAF5Q96JK2 942 aa32.76■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 C1orf141Q5JVX7 400 aa32.75■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 LRRC4BQ9NT99 713 aa32.74■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 ERVV-2B6SEH9 535 aa32.73■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 TMOD3Q9NYL9 352 aa32.73■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 PIGBQ92521 554 aa32.72■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 HMOX1P09601 288 aa32.71■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 NUDCQ9Y266 331 aa32.71■■■□□ 2.83
EHD1-211ENST00000489379 PALLDQ8WX93 1383 aa32.7■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 CASZ1Q86V15 1759 aa32.68■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 AKAP4Q5JQC9 854 aa32.67■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 QSER1Q2KHR3 1735 aa32.67■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 AKT1S1Q96B36 256 aa32.65■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 SPON1Q9HCB6 807 aa32.65■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa32.64■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 SCN11AQ9UI33 1791 aa32.64■■■□□ 2.82
EHD1-211ENST00000489379 TAF1LQ8IZX4 1826 aa32.63■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP32.63■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 RALBP1Q15311 655 aa32.63■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 CABP4P57796 275 aa32.62■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 C5P01031 1676 aa32.62■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 ZNF827Q17R98 1081 aa32.61■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 KCNQ4P56696 695 aa32.59■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa32.58■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 ASAP1Q9ULH1 1129 aa32.58■■■□□ 2.81
EHD1-211ENST00000489379 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa32.57■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 SIK1P57059 783 aa32.57■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 GAS2L2Q8NHY3 880 aa32.57■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 ATG3Q9NT62 314 aa32.57■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 FCHSD2O94868 740 aa32.55■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.55■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 SLC16A10Q8TF71 515 aa32.55■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 ZNF831Q5JPB2 1677 aa32.55■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa32.54■■■□□ 2.8
EHD1-211ENST00000489379 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms