RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488339.1

PRPSAP1-208, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase associated protein 1, human

TSL 2

Gene PRPSAP1, Length 443 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BCL9	O00512	1426 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KCNQ2	O43526	872 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTHFS	P49914	203 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NHS	Q6T4R5	1651 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RREB1	Q92766	1687 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLSCR1	O15162	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IL13	P35225	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BTAF1	O14981	1849 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CYP27B1	O15528	508 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HMOX1	P09601	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TXNRD1	Q16881	649 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.49	□□□□□ -0.25	3e-12	■□□□□ 9.1
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PHKG2	P15735	406 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PROM2	Q8N271	834 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KDR	P35968	1356 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	STK32B	Q9NY57	414 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KCNQ4	P56696	695 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ITGB4	P16144	1822 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PALLD	Q8WX93	1383 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PIGB	Q92521	554 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.42	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SLC15A2	Q16348	729 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LY75	O60449	1722 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CABP4	P57796	275 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RALBP1	Q15311	655 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PRKAR2B	P31323	418 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF827	Q17R98	1081 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LRP5	O75197	1615 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	C5	P01031	1676 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SIK1	P57059	783 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	LGR6	Q9HBX8	967 aa		13.36	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	CASZ1	Q86V15	1759 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	MAP3K5	Q99683	1374 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PRPSAP1-208	ENST00000488339	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27

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