RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 CFAP53Q96M91 514 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 NHSQ6T4R5 1651 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.29■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.27■■□□□ 1.16
HCLS1-208ENST00000487290 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC125Q86Z20 511 aa22.26■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.25■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 CYP27B1O15528 508 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 FAM182BQ5T319 152 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 SPG7Q9UQ90 795 aa22.22■■□□□ 1.15
HCLS1-208ENST00000487290 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 BTAF1O14981 1849 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 ITGB4P16144 1822 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.19■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 RREB1Q92766 1687 aa22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 ANP32CO43423 234 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 FCHSD2O94868 740 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 HMOX1P09601 288 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 PHKG2P15735 406 aa22.17■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 MRC1P22897 1456 aa22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
HCLS1-208ENST00000487290 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM37O94972 964 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 LY75O60449 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.13■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 PRKAR2BP31323 418 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.11■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.1■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 PLSCR1O15162 318 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 DCAF5Q96JK2 942 aa22.09■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 KCNQ2O43526 872 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 PAPPAQ13219 1627 aa22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-208ENST00000487290 BAG6P46379 1132 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 MAP3K5Q99683 1374 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.07■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC184Q52MB2 194 aa22.04■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 APBA3O96018 575 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.03■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
HCLS1-208ENST00000487290 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.01■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 PIGBQ92521 554 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.99■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 MRS2Q9HD23 443 aa21.98■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 NFE2L2Q16236 605 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 RUNDC1Q96C34 613 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.97■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 NEFMP07197 916 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 PROM2Q8N271 834 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.96■■□□□ 1.11
HCLS1-208ENST00000487290 C5P01031 1676 aa21.95■■□□□ 1.1
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