RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484571.5

VWA3B-215, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 3

Gene VWA3B, Length 717 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-215ENST00000484571 PROM2Q8N271 834 aa28.29■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.29■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 POLKQ9UBT6 870 aa28.29■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.28■■■□□ 2.12
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.25■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.25■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.24■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.24■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.23■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.23■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.23■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 BTAF1O14981 1849 aa28.21■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 STK32BQ9NY57 414 aa28.21■■■□□ 2.11
VWA3B-215ENST00000484571 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.2■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 MORC1Q86VD1 984 aa28.18■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 SLC15A2Q16348 729 aa28.17■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 EYA1Q99502 592 aa28.17■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 SPON1Q9HCB6 807 aa28.16■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 SPG7Q9UQ90 795 aa28.15■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.15■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.15■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
VWA3B-215ENST00000484571 PAPPAQ13219 1627 aa28.14■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 CASZ1Q86V15 1759 aa28.11■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 CYP27B1O15528 508 aa28.11■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.11■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.08■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.08■■■□□ 2.09
VWA3B-215ENST00000484571 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.07■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 LY75O60449 1722 aa28.05■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.04■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 AKT1S1Q96B36 256 aa28.04■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 MTFR1LQ9H019 292 aa28.02■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
VWA3B-215ENST00000484571 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 PHKG2P15735 406 aa28■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF827Q17R98 1081 aa28■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 AMOTQ4VCS5 1084 aa28■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.99■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.98■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.98■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 KDRP35968 1356 aa27.98■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 ZBTB7AO95365 584 aa27.97■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 IL13P35225 146 aa27.97■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.97■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 PALLDQ8WX93 1383 aa27.97■■■□□ 2.07
VWA3B-215ENST00000484571 PTGER2P43116 358 aa27.95■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 MTHFSP49914 203 aa27.94■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 PIGBQ92521 554 aa27.94■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.94■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.93■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 DCAF5Q96JK2 942 aa27.92■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.92■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 ITGB4P16144 1822 aa27.91■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.91■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.91■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.91■■■□□ 2.06
VWA3B-215ENST00000484571 KCNQ4P56696 695 aa27.88■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.88■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.88■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.86■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 C5P01031 1676 aa27.86■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 MAP3K5Q99683 1374 aa27.84■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.83■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.83■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 SIK1P57059 783 aa27.83■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 ARXQ96QS3 562 aa27.83■■■□□ 2.05
VWA3B-215ENST00000484571 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.82■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 POLD1P28340 1107 aa27.82■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.81■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 ATG3Q9NT62 314 aa27.8■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.8■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.8■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.79■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 C4BP0C0L5 1744 aa27.78■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 CABP4P57796 275 aa27.78■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 AK7Q96M32 723 aa27.78■■■□□ 2.04
VWA3B-215ENST00000484571 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms