RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484147.5

PTPN22-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, human

TSL 2

Gene PTPN22, Length 2,258 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN22-205	ENST00000484147	DMTN	Q08495	405 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	MSH6	P52701	1360 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	TPM2	P07951	284 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	PTMS	P20962	102 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	FMN1	Q68DA7	1419 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	HTRA3	P83110	453 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	MAFG	O15525	162 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	KIF20A	O95235	890 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF787	Q6DD87	383 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	GLI3	P10071	1580 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	NGEF	Q8N5V2	710 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	MAP7D2	Q96T17	732 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ANAPC15	P60006	121 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	CEP120	Q8N960	986 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	APP	P05067	770 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	IRF6	O14896	467 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	TAF3	Q5VWG9	929 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	YY1AP1	Q9H869	796 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	TMEM94	Q12767	1356 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PTPN22-205	ENST00000484147	ABCC1	P33527	1531 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	MTFR1L	Q9H019	292 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ZMYM3	Q14202	1370 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	RALBP1	Q15311	655 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	CNTNAP1	P78357	1384 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147		E9PSI1	815 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	NBPF11	Q86T75	865 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		5	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TNFRSF10A	O00220	468 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ARHGAP33	O14559	1287 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ITGB8	P26012	769 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	RIPK4	P57078	832 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TTC36	A6NLP5	189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	HR	O43593	1189 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	KRT37	O76014	449 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	TERF1	P54274	439 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PTPN22-205	ENST00000484147	CDCA8	Q53HL2	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61

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