RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483199.5

EML3-211, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 3

Gene EML3, Length 1,042 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-211	ENST00000483199	INSR	P06213	1382 aa		29.28	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	PAPPA	Q13219	1627 aa		29.28	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	ZBTB7A	O95365	584 aa		29.27	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		29.27	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	FLT4	P35916	1363 aa		29.26	■■■□□ 2.28
EML3-211	ENST00000483199	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		29.26	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		29.26	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	PTGER2	P43116	358 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		29.25	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.24	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		29.24	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		29.23	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	NSD2	O96028	1365 aa		29.21	■■■□□ 2.27
EML3-211	ENST00000483199	MTFR1L	Q9H019	292 aa		29.2	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	29.2	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		29.2	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	ZNF827	Q17R98	1081 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.19	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		29.17	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	AKT1S1	Q96B36	256 aa		29.16	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	MORC1	Q86VD1	984 aa		29.15	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	POLK	Q9UBT6	870 aa		29.15	■■■□□ 2.26
EML3-211	ENST00000483199	NCAPD2	Q15021	1401 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		29.13	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	LY75	O60449	1722 aa		29.11	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	KCNQ4	P56696	695 aa		29.09	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		29.08	■■■□□ 2.25
EML3-211	ENST00000483199	CYP27B1	O15528	508 aa		29.07	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.06	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	ARX	Q96QS3	562 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		29.04	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	EYA1	Q99502	592 aa		29.03	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	YY1	P25490	414 aa		29.02	■■■□□ 2.24
EML3-211	ENST00000483199	MAP3K5	Q99683	1374 aa		29.01	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		29	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	28.99	■■■□□ 2.23	1e-8	■■■□□ 15.4
EML3-211	ENST00000483199	SPG7	Q9UQ90	795 aa		28.99	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		28.98	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	PALLD	Q8WX93	1383 aa		28.97	■■■□□ 2.23
EML3-211	ENST00000483199	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	POLD1	P28340	1107 aa		28.94	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		28.93	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	ITGB4	P16144	1822 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	PIGB	Q92521	554 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	C5	P01031	1676 aa		28.92	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	MTHFS	P49914	203 aa		28.9	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		28.9	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	PHKG2	P15735	406 aa		28.89	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		28.89	■■■□□ 2.22
EML3-211	ENST00000483199	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		28.87	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	MSH5	O43196	834 aa		28.85	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	UTRN	P46939	3433 aa		28.85	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		28.84	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	IL13	P35225	146 aa		28.83	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	C4B	P0C0L5	1744 aa		28.83	■■■□□ 2.21
EML3-211	ENST00000483199	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	SIK1	P57059	783 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	KLHL34	Q8N239	644 aa		28.81	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		28.8	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		28.8	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	AK7	Q96M32	723 aa		28.79	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	MSL1	Q68DK7	614 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		28.78	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	ATG3	Q9NT62	314 aa		28.77	■■■□□ 2.2
EML3-211	ENST00000483199	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		28.76	■■■□□ 2.19
EML3-211	ENST00000483199	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		28.76	■■■□□ 2.19

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