RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481995.5

HOXB-AS3-211, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 523 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 ITGB4P16144 1822 aa18.19■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.18■□□□□ 0.5
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HOXB-AS3-211ENST00000481995 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 WDR90Q96KV7 1748 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SSFA2P28290 1259 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PANK3Q9H999 370 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 SMIM5Q71RC9 77 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXB-AS3-211ENST00000481995 CAPN15O75808 1086 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 BCS1LQ9Y276 419 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 GNPATO15228 680 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 POLR3GLQ9BT43 218 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 MMP10P09238 476 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.11■□□□□ 0.49
HOXB-AS3-211ENST00000481995 PXDNLA1KZ92 1463 aa18.1■□□□□ 0.49
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