RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477001.1

SEMA5B-210, Transcript of semaphorin 5B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA5B, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5B-210ENST00000477001 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 SBF2Q86WG5 1849 aa28.93■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 KDRP35968 1356 aa28.9■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 RALBP1Q15311 655 aa28.9■■■□□ 2.22
SEMA5B-210ENST00000477001 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 CFAP53Q96M91 514 aa28.88■■■□□ 2.21
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SEMA5B-210ENST00000477001 TRIM37O94972 964 aa28.86■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.86■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.86■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 NHSQ6T4R5 1651 aa28.85■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.83■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 SPG7Q9UQ90 795 aa28.83■■■□□ 2.21
SEMA5B-210ENST00000477001 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.82■■■□□ 2.2
SEMA5B-210ENST00000477001 BAG6P46379 1132 aa28.81■■■□□ 2.2
SEMA5B-210ENST00000477001 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
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SEMA5B-210ENST00000477001 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.78■■■□□ 2.2
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SEMA5B-210ENST00000477001 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.76■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 NUDCQ9Y266 331 aa28.76■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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SEMA5B-210ENST00000477001 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 HMOX1P09601 288 aa28.73■■■□□ 2.19
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SEMA5B-210ENST00000477001 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.72■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 BTAF1O14981 1849 aa28.71■■■□□ 2.19
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SEMA5B-210ENST00000477001 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.71■■■□□ 2.19
SEMA5B-210ENST00000477001 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
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SEMA5B-210ENST00000477001 RREB1Q92766 1687 aa28.7■■■□□ 2.18
SEMA5B-210ENST00000477001 PLSCR1O15162 318 aa28.69■■■□□ 2.18
SEMA5B-210ENST00000477001 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SEMA5B-210ENST00000477001 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SEMA5B-210ENST00000477001 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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SEMA5B-210ENST00000477001 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SEMA5B-210ENST00000477001 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
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SEMA5B-210ENST00000477001 ITGB4P16144 1822 aa28.64■■■□□ 2.18
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SEMA5B-210ENST00000477001 FCHSD2O94868 740 aa28.63■■■□□ 2.17
SEMA5B-210ENST00000477001 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.63■■■□□ 2.17
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SEMA5B-210ENST00000477001 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.62■■■□□ 2.17
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SEMA5B-210ENST00000477001 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.58■■■□□ 2.17
SEMA5B-210ENST00000477001 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.58■■■□□ 2.17
SEMA5B-210ENST00000477001 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.57■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.57■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 LY75O60449 1722 aa28.57■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 ANP32CO43423 234 aa28.55■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.54■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 PROM2Q8N271 834 aa28.54■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 TXNRD1Q16881 649 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 PIGBQ92521 554 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 MRC1P22897 1456 aa28.53■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 MAP3K5Q99683 1374 aa28.52■■■□□ 2.16
SEMA5B-210ENST00000477001 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
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SEMA5B-210ENST00000477001 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.49■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 PAPPAQ13219 1627 aa28.49■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 PALLDQ8WX93 1383 aa28.48■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.47■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
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SEMA5B-210ENST00000477001 CABP4P57796 275 aa28.47■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.15
SEMA5B-210ENST00000477001 NBPF14Q5TI25 921 aa28.45■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 LGR6Q9HBX8 967 aa28.45■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.43■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.41■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 ATG3Q9NT62 314 aa28.41■■■□□ 2.14
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SEMA5B-210ENST00000477001 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.41■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SEMA5B-210ENST00000477001 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.4■■■□□ 2.14
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