RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.15■□□□□ 0.5
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PRAME-211ENST00000476336 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.14■□□□□ 0.5
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PRAME-211ENST00000476336 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
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PRAME-211ENST00000476336 NCAPD2Q15021 1401 aa18.13■□□□□ 0.49
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PRAME-211ENST00000476336 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
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PRAME-211ENST00000476336 YY1P25490 414 aa17.85■□□□□ 0.45
PRAME-211ENST00000476336 PALLDQ8WX93 1383 aa17.85■□□□□ 0.45
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PRAME-211ENST00000476336 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-211ENST00000476336 FCHSD2O94868 740 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-211ENST00000476336 GAS2L2Q8NHY3 880 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-211ENST00000476336 LRRC4BQ9NT99 713 aa17.84■□□□□ 0.45
PRAME-211ENST00000476336 CABP4P57796 275 aa17.83■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 SGIP1Q9BQI5 828 aa17.82■□□□□ 0.44
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PRAME-211ENST00000476336 C5P01031 1676 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 NEFMP07197 916 aa17.81■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.81■□□□□ 0.442e-24■□□□□ 8.6
PRAME-211ENST00000476336 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 TAF1LQ8IZX4 1826 aa17.8■□□□□ 0.44
PRAME-211ENST00000476336 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
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