RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 MCM10Q7L590 875 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 NBPF4Q96M43 638 aa24.38■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHG5O94827 1062 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 CRB1P82279 1406 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 PANK1Q8TE04 598 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 NCAPD2Q15021 1401 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 CHL1O00533 1208 aa24.36■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 KIF16BQ96L93 1317 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 VAMP4O75379 141 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.35■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.34■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 COG6Q9Y2V7 657 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 LRRC37A3O60309 1634 aa24.33■■□□□ 1.49
SYF2-204ENST00000476231 ABCC6O95255 1503 aa24.33■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K5Q99683 1374 aa24.32■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 TSPYL6Q8N831 410 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 RLBP1P12271 317 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.31■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 KIAA0232Q92628 1395 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 RGPD5Q99666 1765 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.3■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 TNNQ9UQP3 1299 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 COL18A1P39060 1754 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 FAM161AQ3B820 660 aa24.29■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 TRIM27P14373 513 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 ERBB3P21860 1342 aa24.28■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 CPDO75976 1380 aa24.27■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SYF2-204ENST00000476231 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.26■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP45Q92619 1136 aa24.25■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.24■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 IL17REQ8NFR9 667 aa24.23■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 IGHDP01880 384 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.21■■□□□ 1.47
SYF2-204ENST00000476231 C8orf34Q49A92 452 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 SKAP1Q86WV1 359 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 MIS18AQ9NYP9 233 aa24.19■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 KRT24Q2M2I5 525 aa24.18■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.17■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 ABCA3Q99758 1704 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 CHRNA2Q15822 529 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.16■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.15■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.14■■□□□ 1.46
SYF2-204ENST00000476231 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.14■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.14■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 ABCC4O15439 1325 aa24.13■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 RGS3P49796 1198 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 LGR6Q9HBX8 967 aa24.12■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.11■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 KDM3BQ7LBC6 1761 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 TEFQ10587 303 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 PTPRCP08575 1304 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.09■■□□□ 1.45
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.7 ms