RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HMOX1P09601 288 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.83■■□□□ 1.73
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TNS2Q63HR2 1409 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEFMP07197 916 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.82■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SOCS7O14512 581 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MEGF6O75095 1541 aa25.81■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCL9O00512 1426 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM182BQ5T319 152 aa25.78■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CYP27B1O15528 508 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.76■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LRRC37A3O60309 1634 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRKAR2BP31323 418 aa25.75■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHKG2P15735 406 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRS2Q9HD23 443 aa25.72■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRIM37O94972 964 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DCAF5Q96JK2 942 aa25.71■■□□□ 1.71
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.69■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.68■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCER2I3L3R5 266 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 APBA3O96018 575 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BAG6P46379 1132 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC184Q52MB2 194 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RUNDC1Q96C34 613 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PLSCR1O15162 318 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNQ2O43526 872 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CABP4P57796 275 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NFE2L2Q16236 605 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.58■■□□□ 1.69
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SBF2Q86WG5 1849 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LGR6Q9HBX8 967 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K5Q99683 1374 aa25.56■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PIGBQ92521 554 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RIPK4P57078 832 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IL17REQ8NFR9 667 aa25.54■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MIER1Q8N108 512 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.53■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TEFQ10587 303 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NHSQ6T4R5 1651 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NGEFQ8N5V2 710 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 APAF1O14727 1248 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TXNRD1Q16881 649 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATG3Q9NT62 314 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEUROD2Q15784 382 aa25.45■■□□□ 1.66
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