RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476111.5

USP22-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

TSL 3

Gene USP22, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-204ENST00000476111 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.64■■□□□ 1.7
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USP22-204ENST00000476111 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
USP22-204ENST00000476111 LY75O60449 1722 aa25.6■■□□□ 1.69
USP22-204ENST00000476111 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.6■■□□□ 1.69
USP22-204ENST00000476111 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.6■■□□□ 1.69
USP22-204ENST00000476111 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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USP22-204ENST00000476111 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
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USP22-204ENST00000476111 PANK3Q9H999 370 aa25.55■■□□□ 1.68
USP22-204ENST00000476111 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.54■■□□□ 1.68
USP22-204ENST00000476111 SPON1Q9HCB6 807 aa25.53■■□□□ 1.68
USP22-204ENST00000476111 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.53■■□□□ 1.68
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USP22-204ENST00000476111 CYP27B1O15528 508 aa25.5■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 ITGB4P16144 1822 aa25.5■■□□□ 1.67
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USP22-204ENST00000476111 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.5■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 EYA1Q99502 592 aa25.5■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 STK32BQ9NY57 414 aa25.5■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 PTGER2P43116 358 aa25.49■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 ZNF827Q17R98 1081 aa25.49■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 AKT1S1Q96B36 256 aa25.49■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.49■■□□□ 1.67
USP22-204ENST00000476111 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.48■■□□□ 1.67
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USP22-204ENST00000476111 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
USP22-204ENST00000476111 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.661e-12■□□□□ 9.1
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USP22-204ENST00000476111 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.41■■□□□ 1.66
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USP22-204ENST00000476111 MTFR1LQ9H019 292 aa25.39■■□□□ 1.66
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USP22-204ENST00000476111 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.31■■□□□ 1.64
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USP22-204ENST00000476111 MAP3K5Q99683 1374 aa25.3■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.29■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.28■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 IL13P35225 146 aa25.28■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.28■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.28■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 C4BP0C0L5 1744 aa25.27■■□□□ 1.64
USP22-204ENST00000476111 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
USP22-204ENST00000476111 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.26■■□□□ 1.63
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USP22-204ENST00000476111 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
USP22-204ENST00000476111 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.25■■□□□ 1.63
USP22-204ENST00000476111 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.24■■□□□ 1.63
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USP22-204ENST00000476111 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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USP22-204ENST00000476111 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.22■■□□□ 1.63
USP22-204ENST00000476111 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.21■■□□□ 1.63
USP22-204ENST00000476111 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
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USP22-204ENST00000476111 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 MTHFSP49914 203 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 SIK1P57059 783 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 ATG3Q9NT62 314 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.19■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.17■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 DCAF5Q96JK2 942 aa25.17■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 ITPK1Q13572 414 aa25.16■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.16■■□□□ 1.62
USP22-204ENST00000476111 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.16■■□□□ 1.62
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