RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 NFE2L2Q16236 605 aa16.58■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 DCTPP1Q9H773 170 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 TSC1Q92574 1164 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 CABP1Q9NZU7 370 aa16.57■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 KRT24Q2M2I5 525 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF428Q96B54 188 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 POLKQ9UBT6 870 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.56■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.55■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa16.54■□□□□ 0.24
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SH3BP1-206ENST00000469947 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP16.52■□□□□ 0.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP44Q96MT7 982 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 MEIS3Q99687 375 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP1-206ENST00000469947 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.5■□□□□ 0.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 MBD3O95983 291 aa16.48■□□□□ 0.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.47■□□□□ 0.23
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SH3BP1-206ENST00000469947 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.45■□□□□ 0.22
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SH3BP1-206ENST00000469947 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PDE1AP54750 535 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 PLCB2Q00722 1185 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP1-206ENST00000469947 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP1-206ENST00000469947 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.43■□□□□ 0.22
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SH3BP1-206ENST00000469947 KIF24Q5T7B8 1368 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 RGS12O14924 1447 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MCM10Q7L590 875 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 USP48Q86UV5 1035 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 AEBP1Q8IUX7 1158 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 MYRIPQ8NFW9 859 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 RILPL2Q969X0 211 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 CBX1P83916 185 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP1-206ENST00000469947 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
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