RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ATG4B-215ENST00000468018 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
ATG4B-215ENST00000468018 MORC1Q86VD1 984 aa20.75■□□□□ 0.91
ATG4B-215ENST00000468018 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
ATG4B-215ENST00000468018 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
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ATG4B-215ENST00000468018 PROM2Q8N271 834 aa20.71■□□□□ 0.91
ATG4B-215ENST00000468018 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.71■□□□□ 0.91
ATG4B-215ENST00000468018 ITGB4P16144 1822 aa20.71■□□□□ 0.91
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ATG4B-215ENST00000468018 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.5■□□□□ 0.87
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ATG4B-215ENST00000468018 ZNF827Q17R98 1081 aa20.48■□□□□ 0.87
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ATG4B-215ENST00000468018 KCNQ4P56696 695 aa20.44■□□□□ 0.86
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ATG4B-215ENST00000468018 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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ATG4B-215ENST00000468018 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.41■□□□□ 0.86
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ATG4B-215ENST00000468018 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-215ENST00000468018 SPON1Q9HCB6 807 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-215ENST00000468018 ATG3Q9NT62 314 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-215ENST00000468018 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.4■□□□□ 0.86
ATG4B-215ENST00000468018 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.39■□□□□ 0.85
ATG4B-215ENST00000468018 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-215ENST00000468018 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-215ENST00000468018 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-215ENST00000468018 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.38■□□□□ 0.85
ATG4B-215ENST00000468018 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.38■□□□□ 0.85
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