RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
PTPRU-206ENST00000465525 MEGF6O75095 1541 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 NFE2L2Q16236 605 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 RIPK4P57078 832 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 BARGINQ6ZT62 677 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 IL2RBP14784 551 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PTPRU-206ENST00000465525 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 WWC1Q8IX03 1113 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 GLI3P10071 1580 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 DISP2A7MBM2 1401 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 RXRBP28702 533 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 DCTN1Q14203 1278 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 POTEAQ6S8J7 498 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF521Q96K83 1311 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRU-206ENST00000465525 EXOC5O00471 708 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 SPG7Q9UQ90 795 aa22.58■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC27Q2M243 656 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 MCM10Q7L590 875 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 NGEFQ8N5V2 710 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 MAP3K5Q99683 1374 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 A0A0G2JS52 829 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 MYT1Q01538 1121 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 DDB1Q16531 1140 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 GOLGA2Q08379 1002 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 LRRC37A3O60309 1634 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 CYP27B1O15528 508 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 PHKG2P15735 406 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRU-206ENST00000465525 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 LGR6Q9HBX8 967 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 WDR63Q8IWG1 891 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 IL17REQ8NFR9 667 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 TNS2Q63HR2 1409 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 PDE3BQ13370 1112 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 SLFN5Q08AF3 891 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRU-206ENST00000465525 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 E9PSI1 815 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 RGS12O14924 1447 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 IL16Q14005 1332 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 DCAF5Q96JK2 942 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 TEFQ10587 303 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 IFT57Q9NWB7 429 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF853P0CG23 659 aa22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms