RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464956.1

USP40-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 3

Gene USP40, Length 185 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-211ENST00000464956 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 ZBTB7CA1YPR0 619 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 LMNB1P20700 586 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 MYO5BQ9ULV0 1848 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 ABCC11Q96J66 1382 aa4.14□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 IQCA1LA6NCM1 817 aa4.13□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
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USP40-211ENST00000464956 POTEJP0CG39 1038 aa4.13□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
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USP40-211ENST00000464956 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.11□□□□□ -1.75
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USP40-211ENST00000464956 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
USP40-211ENST00000464956 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.1□□□□□ -1.75
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USP40-211ENST00000464956 NHSQ6T4R5 1651 aa4.1□□□□□ -1.75
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USP40-211ENST00000464956 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa4.07□□□□□ -1.76
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USP40-211ENST00000464956 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 H0YGN5 161 aa4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 TMF1P82094 1093 aa4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 NOGQ13253 232 aa4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.07□□□□□ -1.76
USP40-211ENST00000464956 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
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