RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 BCL9O00512 1426 aa24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 IL13P35225 146 aa24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 BAG6P46379 1132 aa24.77■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.77■■□□□ 1.56
DDR1-241ENST00000460944 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.76■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.76■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 RALBP1Q15311 655 aa24.75■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 SPG7Q9UQ90 795 aa24.75■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa24.75■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.74■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.72■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 KDRP35968 1356 aa24.71■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 APBA3O96018 575 aa24.71■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.71■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 NHSQ6T4R5 1651 aa24.71■■□□□ 1.55
DDR1-241ENST00000460944 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 NUDCQ9Y266 331 aa24.7■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.69■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.69■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 HMOX1P09601 288 aa24.67■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.67■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 CYP27B1O15528 508 aa24.66■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.65■■□□□ 1.54
DDR1-241ENST00000460944 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.64■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 BTAF1O14981 1849 aa24.63■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 KCNQ2O43526 872 aa24.63■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.63■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 PHKG2P15735 406 aa24.62■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.6■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 PLSCR1O15162 318 aa24.59■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
DDR1-241ENST00000460944 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.58■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 RREB1Q92766 1687 aa24.57■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 ITGB4P16144 1822 aa24.57■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 PRKAR2BP31323 418 aa24.54■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 DCAF5Q96JK2 942 aa24.54■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.53■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.53■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.53■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 FCHSD2O94868 740 aa24.52■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.52■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.52■■□□□ 1.52
DDR1-241ENST00000460944 ANP32CO43423 234 aa24.51■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.51■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 NEFMP07197 916 aa24.5■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 TXNRD1Q16881 649 aa24.49■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.49■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.48■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 NBPF14Q5TI25 921 aa24.48■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 LY75O60449 1722 aa24.47■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 PIGBQ92521 554 aa24.46■■□□□ 1.51
DDR1-241ENST00000460944 MAP3K5Q99683 1374 aa24.45■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 CABP4P57796 275 aa24.45■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.45■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.44■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 PROM2Q8N271 834 aa24.44■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 PALLDQ8WX93 1383 aa24.43■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.43■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.42■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.41■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
DDR1-241ENST00000460944 LGR6Q9HBX8 967 aa24.39■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 STK32BQ9NY57 414 aa24.39■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 MRC1P22897 1456 aa24.38■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.38■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.38■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.37■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.37■■□□□ 1.49
DDR1-241ENST00000460944 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.37■■□□□ 1.49
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