RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USHBP1Q8N6Y0 703 aa36.33■■■■□ 3.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAPPAQ13219 1627 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.31■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DOT1LQ8TEK3 1739 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC4BQ9NT99 713 aa36.28■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.27■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TATP17735 454 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa36.26■■■■□ 3.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGER2P43116 358 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC27A3Q5K4L6 730 aa36.25■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTFR1LQ9H019 292 aa36.24■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.23■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF827Q17R98 1081 aa36.23■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSD2O96028 1365 aa36.21■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF8L1A6NGE4 600 aa36.19■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa36.17■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa36.17■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKT1S1Q96B36 256 aa36.17■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.17■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LY75O60449 1722 aa36.14■■■■□ 3.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASHC2AQ641Q2 1341 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNQ4P56696 695 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGIP1Q9BQI5 828 aa36.13■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLKQ9UBT6 870 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 QSER1Q2KHR3 1735 aa36.1■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCAPD2Q15021 1401 aa36.09■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYP27B1O15528 508 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa36.08■■■■□ 3.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC16A10Q8TF71 515 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARXQ96QS3 562 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa36.06■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKD1L3Q7Z443 1732 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYT17Q9BSW7 474 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PANK3Q9H999 370 aa36.05■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EYA1Q99502 592 aa36.04■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YY1P25490 414 aa36.03■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPG7Q9UQ90 795 aa36.03■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa36.02■■■■□ 3.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa35.98■■■■□ 3.35
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP35.97■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALLDQ8WX93 1383 aa35.97■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POLD1P28340 1107 aa35.96■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB4P16144 1822 aa35.95■■■■□ 3.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K5Q99683 1374 aa35.94■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C5P01031 1676 aa35.93■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.92■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSH5O43196 834 aa35.91■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIGBQ92521 554 aa35.9■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORC1Q86VD1 984 aa35.89■■■■□ 3.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNL2Q8IZJ0 200 aa35.88■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHKG2P15735 406 aa35.87■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGSF1Q8N6C5 1336 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAF1LQ8IZX4 1826 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL34Q8N239 644 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.86■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa35.85■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMOD3Q9NYL9 352 aa35.84■■■■□ 3.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.82■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C4BP0C0L5 1744 aa35.8■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AK7Q96M32 723 aa35.78■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa35.77■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIK1P57059 783 aa35.77■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.77■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UTRNP46939 3433 aa35.76■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MSL1Q68DK7 614 aa35.76■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASAP1Q9ULH1 1129 aa35.76■■■■□ 3.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR162Q16538 588 aa35.74■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMOTQ4VCS5 1084 aa35.71■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERVV-2B6SEH9 535 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00116Q8NCU8 138 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF5Q96JK2 942 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG3Q9NT62 314 aa35.7■■■■□ 3.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AEBP1Q8IUX7 1158 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBR3Q6ZT12 1888 aa35.69■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHF14O94880 888 aa35.68■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1AP38606 617 aa35.68■■■■□ 3.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AMIGO3Q86WK7 504 aa35.68■■■■□ 3.3
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