RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	FLT4	P35916	1363 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	PLSCR1	O15162	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	CAPN15	O75808	1086 aa		12.48	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.47	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	INSR	P06213	1382 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	PANK3	Q9H999	370 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		12.46	□□□□□ -0.41
PARL-208	ENST00000450375	LRP5	O75197	1615 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	KCNQ2	O43526	872 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	NBPF4	Q96M43	638 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	BTAF1	O14981	1849 aa		12.45	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	MEGF6	O75095	1541 aa		12.43	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	NSD2	O96028	1365 aa		12.42	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	POLK	Q9UBT6	870 aa		12.41	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	PROM2	Q8N271	834 aa		12.4	□□□□□ -0.42
PARL-208	ENST00000450375	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.39	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.39	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	SPON1	Q9HCB6	807 aa		12.38	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	EYA1	Q99502	592 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.37	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		12.36	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	ITGB4	P16144	1822 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	NCAPD2	Q15021	1401 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	LY75	O60449	1722 aa		12.34	□□□□□ -0.43
PARL-208	ENST00000450375	CYP27B1	O15528	508 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.33	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	ZBTB7A	O95365	584 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.32	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		12.31	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	KCNQ4	P56696	695 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PHKG2	P15735	406 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	MTHFS	P49914	203 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	POTEH	Q6S545	545 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PARL-208	ENST00000450375	C5	P01031	1676 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	PIGB	Q92521	554 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	IL13	P35225	146 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.26	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	PTGER2	P43116	358 aa		12.25	□□□□□ -0.45
PARL-208	ENST00000450375	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.25	□□□□□ -0.45

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