RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447200.2

SFRP4-202, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SFRP4, Length 849 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-202ENST00000447200 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.9□□□□□ -0.02
SFRP4-202ENST00000447200 MEGF6O75095 1541 aa14.89□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.89□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 ZNF827Q17R98 1081 aa14.87□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 KLHL34Q8N239 644 aa14.87□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.86□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 RTL1A6NKG5 1358 aa14.85□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 MSH5O43196 834 aa14.84□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 PTGER2P43116 358 aa14.84□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 FLT4P35916 1363 aa14.84□□□□□ -0.03
SFRP4-202ENST00000447200 YY1P25490 414 aa14.83□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 MTFR1LQ9H019 292 aa14.83□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 INSRP06213 1382 aa14.83□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PAPPAQ13219 1627 aa14.82□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.82□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.82□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.82□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.81□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.81□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.81□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 LY75O60449 1722 aa14.8□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.8□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 AKT1S1Q96B36 256 aa14.8□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 NSD2O96028 1365 aa14.79□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 ARXQ96QS3 562 aa14.79□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 SYT17Q9BSW7 474 aa14.79□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PANK3Q9H999 370 aa14.79□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 ITGB4P16144 1822 aa14.78□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.78□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.78□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa14.77□□□□□ -0.04
SFRP4-202ENST00000447200 CYP27B1O15528 508 aa14.77□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 EYA1Q99502 592 aa14.77□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 POLKQ9UBT6 870 aa14.77□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.77□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.76□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 MSL1Q68DK7 614 aa14.76□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 ADRA2BP18089 450 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 POLD1P28340 1107 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 SPG7Q9UQ90 795 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.75□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 C5P01031 1676 aa14.74□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.74□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 SMIM5Q71RC9 77 aa14.74□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 PALLDQ8WX93 1383 aa14.73□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.73□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.72□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 PHF14O94880 888 aa14.72□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 GPR162Q16538 588 aa14.72□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 MORC1Q86VD1 984 aa14.72□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.71□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 PIGBQ92521 554 aa14.71□□□□□ -0.05
SFRP4-202ENST00000447200 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.7□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 PHKG2P15735 406 aa14.69□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.69□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 AK7Q96M32 723 aa14.69□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.69□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.68□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.68□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 C4BP0C0L5 1744 aa14.67□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 CHD4Q14839 1912 aa14.67□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.67□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 ATP6V1AP38606 617 aa14.66□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.66□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 SIK1P57059 783 aa14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 NCAPD2Q15021 1401 aa14.65□□□□□ -0.06
SFRP4-202ENST00000447200 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 ATG3Q9NT62 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.64□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 ITPK1Q13572 414 aa14.63□□□□□ -0.07
SFRP4-202ENST00000447200 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms