RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446182.5

PTPRN-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRN, Length 606 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-208ENST00000446182 KCNQ4P56696 695 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 FYB1O15117 783 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 NBPF4Q96M43 638 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 POLD1P28340 1107 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 USHBP1Q8N6Y0 703 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 COL24A1Q17RW2 1714 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRN-208ENST00000446182 LY75O60449 1722 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 TMF1P82094 1093 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 USP47Q96K76 1375 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 GPR162Q16538 588 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 KLHL34Q8N239 644 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 INSRP06213 1382 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 CHD4Q14839 1912 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 FLT4P35916 1363 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 KIF24Q5T7B8 1368 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN-208ENST00000446182 C1QTNF8P60827 252 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 CDCA8Q53HL2 280 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 PALLDQ8WX93 1383 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 CYP27B1O15528 508 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 MSH5O43196 834 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 KIF20BQ96Q89 1820 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 NCAPD2Q15021 1401 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 MSL1Q68DK7 614 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 NSD3Q9BZ95 1437 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 C5P01031 1676 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 PKD1L3Q7Z443 1732 aa14.58□□□□□ -0.07
PTPRN-208ENST00000446182 GRIN3BO60391 1043 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 PIGBQ92521 554 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 AK7Q96M32 723 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 C4BP0C0L5 1744 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 SPG7Q9UQ90 795 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 EYA1Q99502 592 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 ITGB4P16144 1822 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 SMIM5Q71RC9 77 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 PHF14O94880 888 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 SIK1P57059 783 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 POLKQ9UBT6 870 aa14.53□□□□□ -0.08
PTPRN-208ENST00000446182 SSFA2P28290 1259 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ATP10DQ9P241 1426 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 PHKG2P15735 406 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ITPK1Q13572 414 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ADCY9O60503 1353 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ATG3Q9NT62 314 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 GNPATO15228 680 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRN-208ENST00000446182 ATP6V1AP38606 617 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms