RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443696.1

RAI1-AS1-201, RAI1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RAI1-AS1, Length 724 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CDCA8Q53HL2 280 aa17.61■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NBPF6Q5VWK0 638 aa17.61■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NBPF4Q96M43 638 aa17.61■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NHSQ6T4R5 1651 aa17.61■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 USHBP1Q8N6Y0 703 aa17.6■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa17.59■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 MYOM1P52179 1685 aa17.58■□□□□ 0.41
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CGNL1Q0VF96 1302 aa17.58■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.58■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 USP54Q70EL1 1684 aa17.58■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 USP47Q96K76 1375 aa17.57■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa17.57■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 BTAF1O14981 1849 aa17.57■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa17.56■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 RTL1A6NKG5 1358 aa17.54■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa17.54■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 MAP3K5Q99683 1374 aa17.53■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa17.51■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa17.51■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 MEGF6O75095 1541 aa17.51■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 MSL1Q68DK7 614 aa17.5■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 FLAD1Q8NFF5 587 aa17.5■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 INSRP06213 1382 aa17.5■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 UTRNP46939 3433 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 GRIN3BO60391 1043 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NLGN2Q8NFZ4 835 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 POLR3GLQ9BT43 218 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PAPPAQ13219 1627 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NSD2O96028 1365 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 FLT4P35916 1363 aa17.49■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.48■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SPG7Q9UQ90 795 aa17.48■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa17.48■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.47■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 C1QTNF8P60827 252 aa17.47■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 KIF24Q5T7B8 1368 aa17.46■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CYP27B1O15528 508 aa17.46■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 AK7Q96M32 723 aa17.46■□□□□ 0.39
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PALLDQ8WX93 1383 aa17.45■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 RGPD2P0DJD1 1756 aa17.44■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PIGBQ92521 554 aa17.43■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.43■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 DOT1LQ8TEK3 1739 aa17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NSD3Q9BZ95 1437 aa17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PHF14O94880 888 aa17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CHD4Q14839 1912 aa17.42■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 EYA1Q99502 592 aa17.41■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TMOD3Q9NYL9 352 aa17.41■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 WASHC2AQ641Q2 1341 aa17.41■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
RAI1-AS1-201ENST00000443696 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.39■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SIK1P57059 783 aa17.39■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 IFNL2Q8IZJ0 200 aa17.39■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP17.39■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ATP6V1AP38606 617 aa17.38■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 POLKQ9UBT6 870 aa17.38■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 LY75O60449 1722 aa17.38■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 QSER1Q2KHR3 1735 aa17.38■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SMIM5Q71RC9 77 aa17.37■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ASAP1Q9ULH1 1129 aa17.37■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SSFA2P28290 1259 aa17.36■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 GNPATO15228 680 aa17.35■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PHKG2P15735 406 aa17.35■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.35■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 LINC00116Q8NCU8 138 aa17.34■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.34■□□□□ 0.37
RAI1-AS1-201ENST00000443696 AMIGO3Q86WK7 504 aa17.33■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa17.33■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ATG3Q9NT62 314 aa17.32■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 KIF20BQ96Q89 1820 aa17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ITPK1Q13572 414 aa17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 PANK3Q9H999 370 aa17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 IGSF1Q8N6C5 1336 aa17.3■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.3■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 COL24A1Q17RW2 1714 aa17.3■□□□□ 0.36
RAI1-AS1-201ENST00000443696 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms