RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF181Q9P0P0 153 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITSN1Q15811 1721 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GCP02774 474 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLAD1Q8NFF5 587 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.32□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TGFB2P61812 414 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.31□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FCHSD2O94868 740 aa13.3□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GLTPD2A6NH11 291 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOX10P56693 466 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRAM1Q96QH2 718 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THSD7BQ9C0I4 1608 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHADLQ6NUI6 762 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC17A8Q8NDX2 589 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC7Q96M83 1385 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABTB2Q8N961 1025 aa13.27□□□□□ -0.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PASKQ96RG2 1323 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C5P01031 1676 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0G2JLW4 131 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0C4DFX4 3053 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASSF10A6NK89 507 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTECB2RU33 542 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NLRP13Q86W25 1043 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIK3C2GO75747 1445 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DGKZQ13574 1117 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NBPF15Q8N660 670 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RGPD5Q99666 1765 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LTBP1Q14766 1721 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF5Q96JK2 942 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERBB3P21860 1342 aa13.22□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POGKQ9P215 609 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLIT3O75094 1523 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPEP1P16444 411 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBR3Q6ZT12 1888 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSD2O96028 1365 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TIAM2Q8IVF5 1701 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ROCK1Q13464 1354 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMIM5Q71RC9 77 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSKSQ9UJT2 592 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNA3P22001 575 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACEP12821 1306 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEIP0CG38 1075 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POTEJP0CG39 1038 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPNDQ8N594 471 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C4BP0C0L5 1744 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIM2Q9P1W9 311 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CA12O43570 354 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL2RBP14784 551 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEGF6O75095 1541 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SZT2Q5T011 3432 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP10P09238 476 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LMNB1P20700 586 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP47Q96K76 1375 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASSF7Q02833 373 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPY19L2Q6NUT2 758 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LDHDQ86WU2 507 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AK7Q96M32 723 aa13.11□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSFA2P28290 1259 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ECE1P42892 770 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
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