RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429923.5

LSP1-208, Transcript of lymphocyte specific protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LSP1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1-208ENST00000429923 BCL9O00512 1426 aa26.9■■□□□ 1.9
LSP1-208ENST00000429923 CCDC125Q86Z20 511 aa26.89■■□□□ 1.9
LSP1-208ENST00000429923 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
LSP1-208ENST00000429923 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.89■■□□□ 1.9
LSP1-208ENST00000429923 KDRP35968 1356 aa26.88■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 SBF2Q86WG5 1849 aa26.88■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.86■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 NUDCQ9Y266 331 aa26.85■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.83■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 SPG7Q9UQ90 795 aa26.83■■□□□ 1.89
LSP1-208ENST00000429923 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.82■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.82■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 HMOX1P09601 288 aa26.79■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.79■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 EP400Q96L91 3159 aa26.79■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 TRIM37O94972 964 aa26.78■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
LSP1-208ENST00000429923 CYP27B1O15528 508 aa26.76■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 ANP32CO43423 234 aa26.76■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.76■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 NHSQ6T4R5 1651 aa26.75■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.74■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 FCHSD2O94868 740 aa26.72■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 PHKG2P15735 406 aa26.72■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.72■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.71■■□□□ 1.87
LSP1-208ENST00000429923 BAG6P46379 1132 aa26.69■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.69■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 KCNQ2O43526 872 aa26.68■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 APBA3O96018 575 aa26.68■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 ITGB4P16144 1822 aa26.67■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.66■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 PRKAR2BP31323 418 aa26.66■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.66■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 BTAF1O14981 1849 aa26.66■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.65■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.65■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.65■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 PLSCR1O15162 318 aa26.64■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.64■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
LSP1-208ENST00000429923 DCAF5Q96JK2 942 aa26.63■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.62■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.61■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.61■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.6■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.59■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.58■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 NEFMP07197 916 aa26.58■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
LSP1-208ENST00000429923 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 RREB1Q92766 1687 aa26.57■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.57■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 CCDC184Q52MB2 194 aa26.55■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.55■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.54■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 MAP3K5Q99683 1374 aa26.54■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.53■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 PIGBQ92521 554 aa26.53■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.53■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 LY75O60449 1722 aa26.53■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.52■■□□□ 1.84
LSP1-208ENST00000429923 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.51■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 CABP4P57796 275 aa26.51■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 LGR6Q9HBX8 967 aa26.51■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 MRS2Q9HD23 443 aa26.51■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.5■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 TXNRD1Q16881 649 aa26.49■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 PROM2Q8N271 834 aa26.49■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 MRC1P22897 1456 aa26.49■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 NFE2L2Q16236 605 aa26.47■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 IL17REQ8NFR9 667 aa26.47■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 RUNDC1Q96C34 613 aa26.47■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.47■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.46■■□□□ 1.83
LSP1-208ENST00000429923 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms