RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423413.1

TNS1-206, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNS1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-206ENST00000423413 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.11■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.11■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.1■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 NCAPD2Q15021 1401 aa15.09■□□□□ 0.01
TNS1-206ENST00000423413 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 NBPF14Q5TI25 921 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.06■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 EYA1Q99502 592 aa15.06■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.06■□□□□ 0
TNS1-206ENST00000423413 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 SPG7Q9UQ90 795 aa15.05■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 ITGB4P16144 1822 aa15.04■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 KCNQ2O43526 872 aa15.04■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.04■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.03■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 LY75O60449 1722 aa15.03■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 LRP5O75197 1615 aa15.03■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
TNS1-206ENST00000423413 MTHFSP49914 203 aa15.01□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 TXNRD1Q16881 649 aa15.01□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 CYP27B1O15528 508 aa14.98□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.98□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 PROM2Q8N271 834 aa14.98□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 IL13P35225 146 aa14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 AMOTQ4VCS5 1084 aa14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 SLC27A3Q5K4L6 730 aa14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 STK32BQ9NY57 414 aa14.97□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 PAPPAQ13219 1627 aa14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 QSER1Q2KHR3 1735 aa14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.96□□□□□ -0.01
TNS1-206ENST00000423413 KDRP35968 1356 aa14.96□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 PHKG2P15735 406 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 CFAP53Q96M91 514 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 CASZ1Q86V15 1759 aa14.95□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 TAF1LQ8IZX4 1826 aa14.94□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 C5P01031 1676 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 SLC15A2Q16348 729 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.93□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 DCAF5Q96JK2 942 aa14.91□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 PALLDQ8WX93 1383 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 ERVV-2B6SEH9 535 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.9□□□□□ -0.02
TNS1-206ENST00000423413 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 HMOX1P09601 288 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 PPP2R1AP30153 589 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 SPON1Q9HCB6 807 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 NUDCQ9Y266 331 aa14.89□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 PIGBQ92521 554 aa14.88□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.87□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 AKT1S1Q96B36 256 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 C4BP0C0L5 1744 aa14.86□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 CABP4P57796 275 aa14.85□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 ZNF827Q17R98 1081 aa14.85□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa14.85□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 KCNQ4P56696 695 aa14.84□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa14.84□□□□□ -0.03
TNS1-206ENST00000423413 UBR3Q6ZT12 1888 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 SIK1P57059 783 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 RALBP1Q15311 655 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 MTFR1LQ9H019 292 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa14.83□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 ZBTB7AO95365 584 aa14.82□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TNS1-206ENST00000423413 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms