RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LY75O60449 1722 aa23.7■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSD2O96028 1365 aa23.67■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.67■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IP6K1Q92551 441 aa23.67■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP47Q96K76 1375 aa23.66■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.66■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSL1Q68DK7 614 aa23.66■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.64■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APLP1P51693 650 aa23.61■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.61■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.6■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMC1Q8TDI8 760 aa23.59■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF3CO14782 793 aa23.58■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.58■■□□□ 1.37
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.57■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5P01031 1676 aa23.54■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXC9P31274 260 aa23.53■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.53■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEGF6O75095 1541 aa23.53■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMPHP49418 695 aa23.52■■□□□ 1.36
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOMM70O94826 608 aa23.51■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.51■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PALLDQ8WX93 1383 aa23.51■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.5■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AK7Q96M32 723 aa23.5■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.5■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PP64 1363 aa23.5■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.49■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COG3Q96JB2 828 aa23.49■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WWC3Q9ULE0 1092 aa23.47■■□□□ 1.35
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RTL1A6NKG5 1358 aa23.45■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.45■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.45■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF4Q96M43 638 aa23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4BP0C0L5 1744 aa23.44■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF14O94880 888 aa23.43■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSFA2P28290 1259 aa23.43■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.4■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.4■■□□□ 1.34
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.39■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.39■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.37■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBLN1P23142 703 aa23.37■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGFB2P61812 414 aa23.37■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.37■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.36■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JMYQ8N9B5 988 aa23.36■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLRG1Q96E93 195 aa23.36■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.35■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCS1LQ9Y276 419 aa23.35■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR90Q96KV7 1748 aa23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP27B1O15528 508 aa23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEUROD1Q13562 356 aa23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM5Q71RC9 77 aa23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.34■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.33■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MMP10P09238 476 aa23.33■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIK1P57059 783 aa23.33■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FSTL1Q12841 308 aa23.33■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.33■■□□□ 1.33
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIGBQ92521 554 aa23.32■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GNPATO15228 680 aa23.31■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.31■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INSRP06213 1382 aa23.3■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.3■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNS4Q8IZW8 715 aa23.3■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC24A1O60721 1099 aa23.29■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAPN15O75808 1086 aa23.29■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.29■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.28■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0G2JLW4 131 aa23.28■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRELPP51888 382 aa23.28■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGB4P16144 1822 aa23.28■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.28■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.27■■□□□ 1.32
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FLT4P35916 1363 aa23.27■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCHSD2O94868 740 aa23.26■■□□□ 1.31
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP6V1AP38606 617 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms