RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417145.2

GGTLC2-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

TSL 2

Gene GGTLC2, Length 952 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-201ENST00000417145 BCL9O00512 1426 aa27.04■■□□□ 1.92
GGTLC2-201ENST00000417145 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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GGTLC2-201ENST00000417145 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.02■■□□□ 1.92
GGTLC2-201ENST00000417145 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 TRIM37O94972 964 aa27.01■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 SPG7Q9UQ90 795 aa27■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.99■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
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GGTLC2-201ENST00000417145 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 BAG6P46379 1132 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.96■■□□□ 1.91
GGTLC2-201ENST00000417145 NUDCQ9Y266 331 aa26.96■■□□□ 1.91
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GGTLC2-201ENST00000417145 SBF2Q86WG5 1849 aa26.93■■□□□ 1.9
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GGTLC2-201ENST00000417145 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.92■■□□□ 1.9
GGTLC2-201ENST00000417145 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
GGTLC2-201ENST00000417145 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
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GGTLC2-201ENST00000417145 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.9■■□□□ 1.9
GGTLC2-201ENST00000417145 NHSQ6T4R5 1651 aa26.89■■□□□ 1.9
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GGTLC2-201ENST00000417145 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.88■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 KCNQ2O43526 872 aa26.86■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 PHKG2P15735 406 aa26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.84■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
GGTLC2-201ENST00000417145 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
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GGTLC2-201ENST00000417145 PLSCR1O15162 318 aa26.81■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.81■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 ANP32CO43423 234 aa26.8■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 FCHSD2O94868 740 aa26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
GGTLC2-201ENST00000417145 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.79■■□□□ 1.88
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GGTLC2-201ENST00000417145 BTAF1O14981 1849 aa26.77■■□□□ 1.88
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GGTLC2-201ENST00000417145 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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GGTLC2-201ENST00000417145 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.75■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 NEFMP07197 916 aa26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 RREB1Q92766 1687 aa26.73■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.73■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.72■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
GGTLC2-201ENST00000417145 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.7■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 ITGB4P16144 1822 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 TXNRD1Q16881 649 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.69■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 PIGBQ92521 554 aa26.68■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 MAP3K5Q99683 1374 aa26.68■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 CABP4P57796 275 aa26.67■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
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GGTLC2-201ENST00000417145 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 NBPF14Q5TI25 921 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 PROM2Q8N271 834 aa26.65■■□□□ 1.86
GGTLC2-201ENST00000417145 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.63■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 PALLDQ8WX93 1383 aa26.63■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.63■■□□□ 1.85
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GGTLC2-201ENST00000417145 LY75O60449 1722 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.6■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 MRC1P22897 1456 aa26.59■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.58■■□□□ 1.85
GGTLC2-201ENST00000417145 LRP5O75197 1615 aa26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
GGTLC2-201ENST00000417145 MRS2Q9HD23 443 aa26.57■■□□□ 1.84
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