RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.47■■□□□ 1.35
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL13P35225 146 aa23.44■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.42■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.42■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 APBA3O96018 575 aa23.41■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R1AP30153 589 aa23.41■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFAP53Q96M91 514 aa23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPG7Q9UQ90 795 aa23.4■■□□□ 1.34
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.38■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.37■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.36■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDRP35968 1356 aa23.36■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RREB1Q92766 1687 aa23.35■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RALBP1Q15311 655 aa23.35■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.35■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.34■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.34■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NHSQ6T4R5 1651 aa23.33■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYP27B1O15528 508 aa23.33■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNQ2O43526 872 aa23.33■■□□□ 1.33
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SBF2Q86WG5 1849 aa23.31■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMOX1P09601 288 aa23.31■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.31■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDCQ9Y266 331 aa23.31■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLSCR1O15162 318 aa23.3■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.3■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.3■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHKG2P15735 406 aa23.28■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.27■■□□□ 1.32
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.25■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.24■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF5Q96JK2 942 aa23.21■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTAF1O14981 1849 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TXNRD1Q16881 649 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.2■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKAR2BP31323 418 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF14Q5TI25 921 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.18■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PROM2Q8N271 834 aa23.17■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FCHSD2O94868 740 aa23.16■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.16■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.15■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PIGBQ92521 554 aa23.15■■□□□ 1.3
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.14■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PALLDQ8WX93 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CABP4P57796 275 aa23.12■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NEFMP07197 916 aa23.11■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.1■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.1■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K5Q99683 1374 aa23.1■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANP32CO43423 234 aa23.09■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STK32BQ9NY57 414 aa23.09■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.08■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.08■■□□□ 1.29
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CASZ1Q86V15 1759 aa23.07■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ITGB4P16144 1822 aa23.07■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LGR6Q9HBX8 967 aa23.06■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPON1Q9HCB6 807 aa23.06■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.06■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LY75O60449 1722 aa23.05■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNQ4P56696 695 aa23.05■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.05■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.05■■□□□ 1.28
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATG3Q9NT62 314 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms