RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 CHL1O00533 1208 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM27P14373 513 aa27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 KIF16BQ96L93 1317 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 MS4A1P11836 297 aa27.66■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 BRINP3Q76B58 766 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
SH3BP5-204ENST00000412806 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 COL18A1P39060 1754 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 MAP3K5Q99683 1374 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 NCAPD2Q15021 1401 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 AAMPQ13685 434 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 KRT24Q2M2I5 525 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0232Q92628 1395 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 SKAP1Q86WV1 359 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 IGHDP01880 384 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 SLAIN2Q9P270 581 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.57■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 IL17REQ8NFR9 667 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.56■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.55■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 ERBB3P21860 1342 aa27.54■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC6O95255 1503 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCA3Q99758 1704 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.48■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM3BQ7LBC6 1761 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCC4O15439 1325 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 CHRNA2Q15822 529 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 CPDO75976 1380 aa27.46■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.45■■□□□ 1.99
SH3BP5-204ENST00000412806 LGR6Q9HBX8 967 aa27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.42■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 CACNA1FO60840 1977 aa27.41■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 RGS12O14924 1447 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.39■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 RGS3P49796 1198 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC4A2P04920 1241 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE4AP27815 886 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 MEGF6O75095 1541 aa27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRCP08575 1304 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 TEFQ10587 303 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 BACH2Q9BYV9 841 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 G2E3Q7L622 706 aa27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5-204ENST00000412806 PRDM11Q9NQV5 511 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5-204ENST00000412806 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms