RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412425.1

RAB6C-AS1-201, RAB6C antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB6C-AS1, Length 2,454 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ITSN2Q9NZM3 1697 aa8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLIP1P30622 1438 aa8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PTPRKQ15262 1439 aa8.83□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PAX7P23759 505 aa8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MAP2K2P36507 400 aa8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 POLKQ9UBT6 870 aa8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYBPC2Q14324 1141 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZSCAN26Q16670 478 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KDM4CQ9H3R0 1056 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SMC3Q9UQE7 1217 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SCP2P22307 547 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 UVSSAQ2YD98 709 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 AFAP1Q8N556 730 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GBP4Q96PP9 640 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PREX2Q70Z35 1606 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.81□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZMYM3Q14202 1370 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TRIM66O15016 1216 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEFHP12036 1026 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 INHBEP58166 350 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KIF18AQ8NI77 898 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 A2ML1A8K2U0 1454 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FMN1Q68DA7 1419 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CEP89Q96ST8 783 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF445P59923 1031 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MCTP2Q6DN12 878 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MORC1Q86VD1 984 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ATG3Q9NT62 314 aa8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CAND2O75155 1236 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NECTIN2Q92692 538 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA6BA6NDN3 693 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PIP4K2BP78356 416 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 E2F4Q16254 413 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NUB1Q9Y5A7 615 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 PLXNC1O60486 1568 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ZNF428Q96B54 188 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.77□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ETAA1Q9NY74 926 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SYNMO15061 1565 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ABCD1P33897 745 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 CD151P48509 253 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RAB6C-AS1-201ENST00000412425 ALKQ9UM73 1620 aa8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms