RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

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Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 SLIT3O75094 1523 aa25.57■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 IP6K1Q92551 441 aa25.56■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.56■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.56■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.55■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 MCM10Q7L590 875 aa25.55■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 PSME1Q06323 249 aa25.55■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 PTPRCP08575 1304 aa25.53■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 DCCP43146 1447 aa25.52■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
SUMO3-204ENST00000411651 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 MAP3K5Q99683 1374 aa25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 C14orf37Q86TY3 774 aa25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.49■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.48■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 NCAPD2Q15021 1401 aa25.48■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 RGS12O14924 1447 aa25.48■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 USP19O94966 1318 aa25.47■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 GCC1Q96CN9 775 aa25.47■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 FOXO3O43524 673 aa25.47■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.46■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 MSH6P52701 1360 aa25.46■■□□□ 1.67
SUMO3-204ENST00000411651 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 NUCB1Q02818 461 aa25.44■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.43■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 ORAI2Q96SN7 254 aa25.43■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.42■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.41■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.41■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 CACNA1FO60840 1977 aa25.4■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 GCP02774 474 aa25.4■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 ALS2Q96Q42 1657 aa25.4■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 KRT24Q2M2I5 525 aa25.39■■□□□ 1.66
SUMO3-204ENST00000411651 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.38■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.38■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 CHD1LQ86WJ1 897 aa25.37■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.36■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 IL17REQ8NFR9 667 aa25.36■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.35■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 NBPF4Q96M43 638 aa25.35■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.35■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 SLC4A2P04920 1241 aa25.34■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.34■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 TMEM94Q12767 1356 aa25.34■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.34■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 ABCC6O95255 1503 aa25.34■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.33■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.33■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.33■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 STK31Q9BXU1 1019 aa25.33■■□□□ 1.65
SUMO3-204ENST00000411651 ATP10DQ9P241 1426 aa25.32■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 ATF3P18847 181 aa25.32■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 HOXB7P09629 217 aa25.31■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.31■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.31■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.31■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.3■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 SEC24BO95487 1268 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 DCTPP1Q9H773 170 aa25.29■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SUMO3-204ENST00000411651 LNPKQ9C0E8 428 aa25.26■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.25■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.25■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.25■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.25■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 FLIIQ13045 1269 aa25.24■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 CEP85Q6P2H3 762 aa25.24■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 ERBB3P21860 1342 aa25.23■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.22■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 BECN1Q14457 450 aa25.22■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 G2E3Q7L622 706 aa25.22■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SUMO3-204ENST00000411651 USP35Q9P2H5 1018 aa25.22■■□□□ 1.63
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