RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 SLC4A2P04920 1241 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-202ENST00000402738 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.51□□□□□ -0.57
HERC3-202ENST00000402738 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 MAP9Q49MG5 647 aa11.49□□□□□ -0.57
HERC3-202ENST00000402738 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.49□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 HFM1A2PYH4 1435 aa11.49□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 TMC6Q7Z403 805 aa11.49□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 SSH1Q8WYL5 1049 aa11.48□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 GSDMDP57764 484 aa11.48□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.47□□□□□ -0.57
HERC3-202ENST00000402738 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.47□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.47□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 UBE2HP62256 183 aa11.47□□□□□ -0.57
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HERC3-202ENST00000402738 IGF1RP08069 1367 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 NCOA1Q15788 1441 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SKILP12757 684 aa11.46□□□□□ -0.58
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HERC3-202ENST00000402738 NUTM1Q86Y26 1132 aa11.46□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.45□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 STX6O43752 255 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-202ENST00000402738 TXLNAP40222 546 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-202ENST00000402738 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-202ENST00000402738 ZBTB9Q96C00 473 aa11.45□□□□□ -0.58
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HERC3-202ENST00000402738 MX1P20591 662 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 MCM3P25205 808 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 NCAPD3P42695 1498 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 GTF3C6Q969F1 213 aa11.44□□□□□ -0.58
HERC3-202ENST00000402738 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.44□□□□□ -0.58
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