RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394072.7

TNS4-202, Transcript of tensin 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS4, Length 2,174 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS4-202ENST00000394072 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 SULT6B1Q6IMI4 303 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 ABCC4O15439 1325 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 KIAA0232Q92628 1395 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 KDRP35968 1356 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS4-202ENST00000394072 MAP3K19Q56UN5 1328 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 FSD2A1L4K1 749 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 TRAK2O60296 914 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 TSPYL6Q8N831 410 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 NUTM2FA1L443 756 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 CHL1O00533 1208 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 AEBP1Q8IUX7 1158 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 HSCBQ8IWL3 235 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 GCC1Q96CN9 775 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 LRRC37A3O60309 1634 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 IGSF1Q8N6C5 1336 aa14.62□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 NUCB1Q02818 461 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 LTN1O94822 1766 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 FAM83GA6ND36 823 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 CRB1P82279 1406 aa14.61□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 KCNA6P17658 529 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 MRE11P49959 708 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 RTL1A6NKG5 1358 aa14.6□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 PTPRCP08575 1304 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 AMPHP49418 695 aa14.58□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 PANK2Q9BZ23 570 aa14.58□□□□□ -0.07
TNS4-202ENST00000394072 DCTN1Q14203 1278 aa14.58□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 NLRP6P59044 892 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.57□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 NWD1Q149M9 1564 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 CLCN1P35523 988 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 EYA1Q99502 592 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 RGS12O14924 1447 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 MCM10Q7L590 875 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 BABAM1Q9NWV8 329 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 HOXC9P31274 260 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 RBM25P49756 843 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 SNX21Q969T3 373 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 NFAT5O94916 1531 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 SOX12O15370 315 aa14.53□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 ABTB2Q8N961 1025 aa14.52□□□□□ -0.08
TNS4-202ENST00000394072 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 GBP4Q96PP9 640 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 LNPKQ9C0E8 428 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 DDIT3P35638 169 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 ANKRD45Q5TZF3 282 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 MAP3K5Q99683 1374 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 PTMSP20962 102 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 DCTPP1Q9H773 170 aa14.5□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 ATP10DQ9P241 1426 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 ANKRD44Q8N8A2 993 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 KIF1AQ12756 1690 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 KCNH5Q8NCM2 988 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 ESPNB1AK53 854 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 IP6K1Q92551 441 aa14.48□□□□□ -0.09
TNS4-202ENST00000394072 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms