RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.76■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.74■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF14Q5TI25 921 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 MORC1Q86VD1 984 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD39-201ENST00000393537 BTAF1O14981 1849 aa27.7■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TATP17735 454 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PROM2Q8N271 834 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAPD2Q15021 1401 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 EYA1Q99502 592 aa27.65■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 LRP5O75197 1615 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 TXNRD1Q16881 649 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD39-201ENST00000393537 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.62■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP27B1O15528 508 aa27.56■■■□□ 2
ANKRD39-201ENST00000393537 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
ANKRD39-201ENST00000393537 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD39-201ENST00000393537 SPG7Q9UQ90 795 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD39-201ENST00000393537 STK32BQ9NY57 414 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD39-201ENST00000393537 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 PAPPAQ13219 1627 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 LY75O60449 1722 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 MTHFSP49914 203 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC15A2Q16348 729 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 CASZ1Q86V15 1759 aa27.49■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB4P16144 1822 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.46■■□□□ 1.99
ANKRD39-201ENST00000393537 IL13P35225 146 aa27.45■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.45■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.45■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNQ4P56696 695 aa27.44■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.44■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PHKG2P15735 406 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF827Q17R98 1081 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 SPON1Q9HCB6 807 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 KDRP35968 1356 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD39-201ENST00000393537 PALLDQ8WX93 1383 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBTB7AO95365 584 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PIGBQ92521 554 aa27.38■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 AKT1S1Q96B36 256 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.34■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 C5P01031 1676 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD39-201ENST00000393537 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 HMOX1P09601 288 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.32■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 DCAF5Q96JK2 942 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.31■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 MTFR1LQ9H019 292 aa27.29■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.28■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 PTGER2P43116 358 aa27.27■■□□□ 1.96
ANKRD39-201ENST00000393537 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 ATG3Q9NT62 314 aa27.25■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP2R1AP30153 589 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 SIK1P57059 783 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 CABP4P57796 275 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP53Q96M91 514 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 C4BP0C0L5 1744 aa27.24■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.21■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ANKRD39-201ENST00000393537 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.2■■□□□ 1.94
ANKRD39-201ENST00000393537 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
ANKRD39-201ENST00000393537 MSH5O43196 834 aa27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms