RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 KRT24Q2M2I5 525 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 CRB1P82279 1406 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 ATP10DQ9P241 1426 aa32.83■■■□□ 2.85
HOXD13-201ENST00000392539 DDX11L8A8MPP1 907 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 EID1Q9Y6B2 187 aa32.79■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 MSH6P52701 1360 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 TTC22Q5TAA0 569 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 CEP85Q6P2H3 762 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 SBNO1A3KN83 1393 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 TRAK2O60296 914 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 MAP3K19Q56UN5 1328 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 RTL1A6NKG5 1358 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 SLC26A8Q96RN1 970 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 FLT4P35916 1363 aa32.76■■■□□ 2.84
HOXD13-201ENST00000392539 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 SLIT1O75093 1534 aa32.75■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 SOX12O15370 315 aa32.74■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 KDRP35968 1356 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa32.73■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 DIP2AQ14689 1571 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 ARHGAP23Q9P227 1491 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 SLC4A2P04920 1241 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 TBX22Q9Y458 520 aa32.72■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 FSD2A1L4K1 749 aa32.71■■■□□ 2.83
HOXD13-201ENST00000392539 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 RAB3GAP1Q15042 981 aa32.7■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 MEIS3Q99687 375 aa32.7■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 TSPYL4Q9UJ04 414 aa32.7■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 PIK3C2AO00443 1686 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 GAS2L2Q8NHY3 880 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 GBP4Q96PP9 640 aa32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 IGSF1Q8N6C5 1336 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 FOXO3O43524 673 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 HMMRO75330 724 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 AMPHP49418 695 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 MIS18AQ9NYP9 233 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 CCT4P50991 539 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 RABEP1Q15276 862 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 PTMSP20962 102 aa32.65■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 EYA1Q99502 592 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 LRRC37A3O60309 1634 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXD13-201ENST00000392539 CASC1Q6TDU7 716 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 USP26Q9BXU7 913 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 CACNA1FO60840 1977 aa32.62■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 G2E3Q7L622 706 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 SDSP20132 328 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 ANKARQ7Z5J8 1434 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 USP54Q70EL1 1684 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP32.59■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 STK31Q9BXU1 1019 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 SLC4A10Q6U841 1118 aa32.58■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
HOXD13-201ENST00000392539 FOXD4L1Q9NU39 408 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 APBB1O00213 710 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 F6X3S4 739 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 MRE11P49959 708 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.55■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 GNAI2P04899 355 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP6P59044 892 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 OSBPL3Q9H4L5 887 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 GNAT3A8MTJ3 354 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC30Q5VVM6 783 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 ARXQ96QS3 562 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 REC8O95072 547 aa32.51■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 CLEC17AQ6ZS10 378 aa32.51■■■□□ 2.8
HOXD13-201ENST00000392539 HOXC9P31274 260 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD13-201ENST00000392539 NWD1Q149M9 1564 aa32.5■■■□□ 2.79
HOXD13-201ENST00000392539 GNAI3P08754 354 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXD13-201ENST00000392539 BABAM1Q9NWV8 329 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXD13-201ENST00000392539 FLIIQ13045 1269 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXD13-201ENST00000392539 SSFA2P28290 1259 aa32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms